| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1870380 | 283 (0.740) | 14 (0.040) | 6/94 | NT | 5.0% | coding (451/1182 nt) | yeaN | putative transporter |
| ? | CP009273 | = 1870397 | 289 (0.890) | coding (468/1182 nt) | yeaN | putative transporter | |||||
Only 100 of 447 total aligned reads displayed.
TCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTG > CP009273/1870330‑1870463 | tCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTc > 1:4421723/1‑68 (MQ=255) cAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtg > 1:16529759‑M2/1‑64 (MQ=255) gACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:21181796‑M2/67‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:8686424‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:22862367‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:2329158‑M2/66‑6 (MQ=255) cTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgc > 1:2439105‑M2/1‑60 (MQ=255) cTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccg > 1:25654298‑M2/1‑60 (MQ=255) aCCGGCGCATATTCCCTGCCACTGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGc < 1:9213617/68‑1 (MQ=255) aCCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGc < 1:661839/68‑1 (MQ=255) aCCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGc < 1:31095122/68‑1 (MQ=255) ccGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCt > 1:20794101/1‑68 (MQ=255) cGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCtt < 1:18570126/68‑1 (MQ=255) gcATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGa > 1:31555355/1‑67 (MQ=255) gcATATTCCCTGACAATGGGACCTGCAGCGGCACGGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctgcagctcc > 1:17217506‑M2/1‑51 (MQ=255) atatTCCCTCACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctgcagctccca > 1:4863952‑M2/1‑49 (MQ=255) tatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACgg < 1:21928496/68‑1 (MQ=255) tatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACgg < 1:30268669/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:29896811/68‑1 (MQ=255) ttCCCTGCCAATGGGAGCTGCCGCGGCACTGGGAGCGGCTATGGGCgggccgctgcagctcccattgt > 1:17894537‑M2/1‑46 (MQ=255) ttCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctgcagctcccattgt > 1:28992038‑M2/1‑46 (MQ=255) ttCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGGCgtgccgctgcagctcccattgt > 1:22301810‑M2/1‑46 (MQ=255) tCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGttt > 1:11993415/1‑68 (MQ=255) tCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGttt > 1:24675142/1‑68 (MQ=255) tCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGttt > 1:11642117/1‑68 (MQ=255) ccTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:18429388/1‑68 (MQ=255) ccTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:15465539/1‑68 (MQ=255) cTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctgcagctcccattgtcagg > 1:30485641‑M2/1‑42 (MQ=255) tGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:20973344/1‑66 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:18142104/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:28357894/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:25383740/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:8043736/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:7457290/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:13975673/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:16346833/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:19583050/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:373212/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:2937583/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:20656389/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACAGTTTtggctg > 1:29753989/1‑68 (MQ=255) aaTGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGTTCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGGTTTGAACGGTTTtggctggc > 1:27851362/1‑68 (MQ=255) aaTGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctggc > 1:2007442/1‑68 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:30626150/1‑67 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:16731068/1‑67 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:5224473/1‑67 (MQ=255) gAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgc > 1:17469641/1‑68 (MQ=255) aGCTGCAGCGGCTCTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgc > 1:32054276/1‑67 (MQ=255) aGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGGCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgc < 1:15104022/67‑1 (MQ=255) cTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGcgcg > 1:11823466/1‑68 (MQ=255) tGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgcgc < 1:13322756/66‑1 (MQ=255) tGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgcgc < 1:14561563/66‑1 (MQ=255) tGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGcgcg < 1:27307106/67‑1 (MQ=255) ggCAGTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTAGCTCa > 1:23045778/1‑68 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:30125101/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:9439168/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:21353/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:20601357/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:12210874/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:8265115/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCa > 1:22079263/1‑68 (MQ=255) cACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt < 1:19312722/67‑1 (MQ=255) cACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt < 1:7741032/67‑1 (MQ=255) gggATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGTACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGa < 1:23971336/68‑1 (MQ=255) gggATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGa < 1:12459079/68‑1 (MQ=255) gggATCGGATATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCACGGCGCGTTGCTCATGCTGa > 1:5678645/1‑68 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:26602016/1‑68 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:1000664/1‑68 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:11574415/1‑68 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:31404304/1‑68 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:12808995/1‑68 (MQ=255) aTCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgt > 1:11270096/1‑68 (MQ=255) aTCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg < 1:6039188/67‑1 (MQ=255) tCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgt < 1:27000202/67‑1 (MQ=255) tCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgt < 1:10977345/67‑1 (MQ=255) tCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgt < 1:30972612/67‑1 (MQ=255) gcGGCTATGGGCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgt < 1:8586719/66‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:26370749/68‑1 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:10293038/1‑68 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:29568974/1‑68 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGtta > 1:15930588/1‑67 (MQ=255) cTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:7037705/1‑67 (MQ=255) cTATGGCCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:4191285/1‑67 (MQ=255) tATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGtttt < 1:28057671/67‑1 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:13597804/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:10578660/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:7205008/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:3225244/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:14633399/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:4968544/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:15025710/1‑65 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:19084766/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:364941/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:5492116/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:2151998/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct < 1:21762444/67‑1 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:22547528/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:24846469/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:25986175/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:18774874/1‑67 (MQ=255) | TCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTG > CP009273/1870330‑1870463 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |