| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4156417 = | NA (NA) | 12 (0.030) | 4/112 | NT | NA | intergenic (+204/‑170) | murI/rrsB | glutamate racemase/16S ribosomal RNA of rrnB operon |
| ? | CP009273 | 4197929 = | NA (NA) | intergenic (‑469/‑146) | purH/rrsE | fused IMP cyclohydrolase/phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/16S ribosomal RNA of rrnE operon | |||||
TAAATTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4156459‑4156417‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTCGC > CP009273/4197929‑4197994 TAAATTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGA < 1:23063563/67‑1TAAATAGTTAAAGAGCAGGGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGA < 1:4561897/67‑1 ATTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAAT < 1:21777730/68‑1 TGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCT < 1:20721395/68‑1 GTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTG < 1:22013229/68‑1 GTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTG < 1:27972447/68‑1 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG < 1:7085806/68‑1 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:15121158/1‑68 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG < 1:16793959/68‑1 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG < 1:27742737/68‑1 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAAC < 1:27576138/67‑1 AGCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAAC < 1:31501202/67‑1 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGT > 1:3340072/1‑68 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:22688090/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:26674074/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:266035/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:27616182/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:345466/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:35428427/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:38703038/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:4964589/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:498722/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:7173840/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:9922449/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:11008245/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:13440590/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:15801429/1‑67 GCGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACG > 1:19636556/1‑67 CGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:22086514/1‑68 CGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:14035485/1‑68 CGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:39124880/1‑68 CGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:38515288/1‑68 CGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:1784436/1‑68 CGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:2941974/1‑68 CGGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:26489627/1‑68 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:22577217/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:20222742/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:9840585/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:8394778/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:5944681/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:5614782/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:14442916/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:4127337/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:26005514/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:21780415/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:38342367/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:10015644/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:17893557/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:28690866/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:21540079/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:29695062/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:1602579/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:16206152/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:34511359/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:34826879/67‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC > 1:35249993/1‑67 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGT < 1:25222271/66‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGT < 1:8095663/66‑1 GGCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGT < 1:16041528/66‑1 GGCACTGCTCTTAAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTC < 1:15406283/67‑1 GCACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTCGC > 1:7369289/1‑68 GCACTGCTCTTCAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTCGC > 1:25529634/1‑68 CACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTCGC < 1:15755582/67‑1 TAAATTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4156459‑4156417‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTGCTCTTTAACAATTTATCAGACAATCTGTGTGGGCACTCGAAGATACGGATTCTTAACGTCGC > CP009273/4197929‑4197994 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |