| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4161825 = | NA (NA) | 11 (0.030) | 6/96 | NT | 100% | intergenic (+141/‑160) | rrfB/murB | 5S ribosomal RNA of rrnB operon/UDP‑N‑acetylenolpyruvoylglucosamine reductase, FAD‑binding |
| ? | CP009273 | 4161830 = | 0 (0.000) | intergenic (+146/‑155) | rrfB/murB | 5S ribosomal RNA of rrnB operon/UDP‑N‑acetylenolpyruvoylglucosamine reductase, FAD‑binding | |||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
GGACAAATCCGCCGGGAGCGGATTTGAACGTTGCGAAGCAACGGCCCGGAGGGTGGCGGGCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGTTT > CP009273/4161764‑4161897 | aaacggccatccggcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:31925555‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:25488078‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:34063712‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:15080923‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:5100804‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:25190922‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:6224426‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:21685204‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:11806811‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:28081692‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:28984214‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:10399019‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:39263740‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccggcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:25130589‑M2/2‑1 (MQ=255) aaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGcc < 1:30215645‑M2/3‑1 (MQ=255) aaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGcc < 1:7789621‑M2/3‑1 (MQ=255) aaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc > 1:6022462‑M2/66‑67 (MQ=255) aaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc > 1:16259626‑M2/66‑67 (MQ=255) aaaggccatccgtcaggatggccttctgcgtaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc > 1:19938616‑M2/66‑67 (MQ=255) aaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:33360491‑M2/65‑68 (MQ=255) aaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:32936749‑M2/65‑68 (MQ=255) aaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:851276‑M2/65‑68 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:33235396‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:24405655‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:26397093‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:20873161‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:3469271‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:36313400‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:12201730‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:14008104‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:16075880‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:15386324‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgaagcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:35504943‑M2/64‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:5244650‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:30986007‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:25943829‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:1226022‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:29540069‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:7666976‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:24184455‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:32505308‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:15788759‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:2234279‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:16964344‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:34532082‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:39371214‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:18341643‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:10976118‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:28548153‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggccggcgtcctGcc > 1:14570129‑M2/63‑65 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagttaatggcgggcgtcctGCCCg > 1:26396730‑M2/63‑67 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:7469340‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:31409328‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:5950909‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:5773635‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:38539775‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:38794421‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:9386430‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:12596938‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:19367544‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcagcatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:11423943‑M2/62‑68 (MQ=255) ccatcctgcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:21301766‑M2/7‑1 (MQ=255) ccatccgtgaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:14175339‑M2/7‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:27576905‑M2/61‑67 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:29849343‑M2/7‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:12432418‑M2/7‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:13530341‑M2/7‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:36578896‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:10044681‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:17814368‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:3808679‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:35784344‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:20290696‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:32042148‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:23882815‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:25670548‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:23330136‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagggtatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:2833902‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgctaaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:19036077‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccctcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:24859156‑M2/7‑1 (MQ=255) catccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGCCa > 1:35038982‑M2/60‑67 (MQ=255) catccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGCCa < 1:16330634‑M2/8‑1 (MQ=255) catccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGCCAt < 1:25999399‑M2/9‑1 (MQ=255) catccgtcaggatggccttctgcttaatatgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGCCa < 1:18507032‑M2/8‑1 (MQ=255) gtcctGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCttttt > 1:6703390‑M2/6‑67 (MQ=255) aCGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGt > 1:10223513/1‑68 (MQ=33) aCGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGt > 1:17528038/1‑68 (MQ=33) cgcccgccATAAACTGCCATGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCAGACGGATGGCCTTTTTGCGtg > 1:23059782/1‑67 (MQ=11) cgcccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGtt < 1:19666413/68‑1 (MQ=35) cgcccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGtt > 1:15462799/1‑68 (MQ=35) cgcccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGtg > 1:34299267/1‑67 (MQ=18) cgcccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGtg > 1:2916833/1‑67 (MQ=18) cgcccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGtg < 1:22634710/68‑2 (MQ=18) cgcccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCGGACGGATGGCCTTTTTGCGtg > 1:39194874/1‑67 (MQ=16) cgcccgccATAAACTGCCAGGCAGCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGtt < 1:13206645/68‑1 (MQ=25) GCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGcgtgg < 1:25391300‑M2/68‑3 (MQ=255) GCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGcgtgg < 1:4142252‑M2/68‑3 (MQ=255) GCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGcgtgg < 1:37053806‑M2/68‑3 (MQ=255) GCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGcgtgg < 1:11304302‑M2/68‑3 (MQ=255) GCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGcgtgg < 1:22957433‑M2/68‑3 (MQ=255) | GGACAAATCCGCCGGGAGCGGATTTGAACGTTGCGAAGCAACGGCCCGGAGGGTGGCGGGCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGTTT > CP009273/4161764‑4161897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |