| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4607857 = | 434 (0.910) | 10 (0.020) | 6/96 | NT | 2.6% | coding (718/780 nt) | deoC | 2‑deoxyribose‑5‑phosphate aldolase, NAD(P)‑linked |
| ? | CP009273 | 4607913 = | NA (NA) | coding (774/780 nt) | deoC | 2‑deoxyribose‑5‑phosphate aldolase, NAD(P)‑linked | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 520 total aligned reads displayed.
GCGCTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTACCC > CP009273/4607846‑4607977 | cgcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCagcagc < 1:30894169/67‑1 (MQ=255) cgcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCagcagc < 1:39143224/67‑1 (MQ=255) cgcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGGCACGGCGACGGTAAGAGCGCCagcagc < 1:10045538/67‑1 (MQ=255) cgcTGCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCagcagc < 1:36155229/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:32423393/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:12602993/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:26628917/67‑1 (MQ=255) ttagtagctgctggcgctcttaccgtcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagctact < 1:5708943‑M2/5‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGctac < 1:32911564/67‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaa < 1:37383615/68‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaa < 1:35223122/68‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaa < 1:38787862/68‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaa < 1:24047379/68‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaa < 1:5198067/68‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaa < 1:19370084/68‑1 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:29963068/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:21469573/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:25414194/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:6631513/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:23444422/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:23095551/1‑68 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:25759261‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:18600613‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:29793369‑M1/1‑65 (MQ=255) TGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa < 1:21325428‑M1/66‑1 (MQ=255) GCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGAt > 1:38208714‑M1/1‑68 (MQ=255) GCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGAt > 1:17743513‑M1/1‑68 (MQ=255) GCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGAt > 1:28142746‑M1/1‑68 (MQ=255) TGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCGGGGGCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGc > 1:19719024‑M1/1‑68 (MQ=255) ggcgctcttaccgtcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagCTACTAAGTAAGATGCt < 1:31605746‑M2/17‑1 (MQ=255) GGCAAGCCTTCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:21109251‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGc > 1:27237140‑M1/1‑67 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:15073969‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:6355444‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:37129205‑M1/1‑68 (MQ=255) CAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCttt < 1:7736848‑M1/68‑1 (MQ=255) CAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCttt < 1:38967846‑M1/68‑1 (MQ=255) aGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTAc > 1:18219380/1‑68 (MQ=255) tcttaccgtcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACg < 1:1565011‑M2/22‑1 (MQ=255) gCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTAc > 1:32287707/1‑67 (MQ=255) ttaccgtcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGcc < 1:5367513‑M2/24‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACg < 1:33906563/66‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACg < 1:34217436/66‑1 (MQ=255) tgAAAGCGTTGGTTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCtca < 1:28597453/67‑3 (MQ=255) aGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgc > 1:16107703/1‑66 (MQ=255) gcgggggCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:2514962/65‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:39322959/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:10541025/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:27556188/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:15732967/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:4629434/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:20307912/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:21988369/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:14043198/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:2552012/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgct < 1:16598124/66‑1 (MQ=255) gcTGGGGCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:1882886/68‑1 (MQ=255) gggTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATgcgctgcgct < 1:2469331/68‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:22693505/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:36312499/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:16728682/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa > 1:36452718/1‑67 (MQ=255) aCGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCa > 1:26171727/1‑68 (MQ=255) aCGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCa > 1:11402296/1‑68 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:5052773/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:184637/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:13060876/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:10353867/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAg > 1:9160072/1‑67 (MQ=255) gCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg > 1:2056683/1‑67 (MQ=255) cGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGc < 1:7024263/67‑1 (MQ=255) aCGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTa < 1:30243460/68‑1 (MQ=255) cGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTa < 1:8205432/67‑1 (MQ=255) cGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTa < 1:38576683/67‑1 (MQ=255) ggTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACg > 1:12242985/1‑68 (MQ=255) tAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACgag > 1:36050949/1‑68 (MQ=255) tAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACga < 1:9465142/67‑1 (MQ=255) agagCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGAc > 1:35609692/1‑68 (MQ=255) agagCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGAc > 1:11074363/1‑68 (MQ=255) gagCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACg > 1:17262389/1‑68 (MQ=255) agCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt > 1:10234981/1‑68 (MQ=255) agCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt > 1:870042/1‑68 (MQ=255) agCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt > 1:24424078/1‑68 (MQ=255) agCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt > 1:33527768/1‑68 (MQ=255) agCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt > 1:3197442/1‑68 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:4194690/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:35095802/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:7428540/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:6006804/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:22307874/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:2882456/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa > 1:30533245/1‑68 (MQ=255) gccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTAt < 1:11675048‑M2/59‑1 (MQ=255) gccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTAt < 1:37573221‑M2/59‑1 (MQ=255) gcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAc > 1:22458257‑M2/5‑67 (MQ=255) gcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAc > 1:14458076‑M2/5‑67 (MQ=255) agCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAccc < 1:20902735‑M2/65‑1 (MQ=255) agCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAcc < 1:1487046‑M2/64‑1 (MQ=255) agCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAcc < 1:13555181‑M2/64‑1 (MQ=255) agCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAcc < 1:2589156‑M2/64‑1 (MQ=255) | GCGCTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTACCC > CP009273/4607846‑4607977 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |