| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1238033 = | 568 (1.200) | 21 (0.070) | 16/76 | NT | 6.4% | coding (504/915 nt) | ldcA | murein tetrapeptide carboxypeptidase; LD‑carboxypeptidase A |
| ? | CP009273 | 1238051 = | 230 (0.710) | coding (486/915 nt) | ldcA | murein tetrapeptide carboxypeptidase; LD‑carboxypeptidase A | |||||
Only 100 of 691 total aligned reads displayed.
CGATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTAAAGG > CP009273/1237984‑1238118 | gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCt > 1:27452321/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCt > 1:14163603/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCtt > 1:35299652/1‑68 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:10149790/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:25838971/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:30315455/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:21779880/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:21546293/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:31022702/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:32851086/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:17495960/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:17076522/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:39510006/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:10570792/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:11304922/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:6574972/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:10963482/1‑67 (MQ=255) ggctggcgttacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:29566585‑M1/48‑68 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCTCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc < 1:29052208/68‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc < 1:14538207/68‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc < 1:3215116/68‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc < 1:28806370/68‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc < 1:9811104/67‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:8807970/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc < 1:22130809/67‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:36993132/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:1672990/1‑67 (MQ=255) ctggcgttacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc > 1:635159‑M1/46‑67 (MQ=255) cAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTccc < 1:13032015/68‑1 (MQ=255) gAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCtt < 1:24009591/67‑1 (MQ=255) gAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCtt < 1:34021919/67‑1 (MQ=255) aaaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGc < 1:37363586/68‑1 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc < 1:29358712/68‑1 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc < 1:1247920/68‑1 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc < 1:5613832/68‑1 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc < 1:18645231/68‑1 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc < 1:4773563/68‑1 (MQ=255) aTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCa > 1:16332502/1‑68 (MQ=255) ttaGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATTTCCGGCCTTCCCCGTGCCAt > 1:28594216/3‑68 (MQ=255) tCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt < 1:33916991/68‑1 (MQ=255) tCAGCATCGCAACATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt < 1:28374948/68‑1 (MQ=255) gcctCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCGTCGGCCCGAAATGTCTGGCCTTCCCCTTGCCATTCa < 1:19549458/65‑1 (MQ=255) atgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAAt < 1:33486944‑M2/18‑1 (MQ=255) aTCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCa < 1:25972425/66‑1 (MQ=255) aTCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAAt > 1:15944002/1‑68 (MQ=255) cGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATgg < 1:30883243/68‑1 (MQ=255) cGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATgg < 1:12822543/68‑1 (MQ=255) cAATATTGCCTCCCCACACCGTGCCTGCGGCCCGACATGTGGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGt < 1:1039470/67‑1 (MQ=255) aaGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGa < 1:37706403/68‑1 (MQ=255) aTTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGGAgg > 1:1202845/1‑68 (MQ=255) aTTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAgg > 1:20365090/1‑68 (MQ=255) ttGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAg < 1:20660641/66‑1 (MQ=255) ttGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAg < 1:22896409/66‑1 (MQ=255) ttGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGt < 1:33036842/68‑1 (MQ=255) tGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGtt > 1:39207589/1‑68 (MQ=255) tGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTAGGGCCTTACCCTTGGCATTAAATGGTGAAGGtt > 1:9089590/1‑68 (MQ=255) accattgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGttt > 1:27080350‑M1/22‑68 (MQ=255) ccACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGc < 1:35688995/68‑1 (MQ=255) ccACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGc < 1:36098052/68‑1 (MQ=255) ccACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGc < 1:20976544/68‑1 (MQ=255) acaACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGt > 1:25655989/1‑68 (MQ=255) acaACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGt > 1:1875190/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCTTCCCCGTGCCAGTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:5197705/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCATTGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:4475092/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc < 1:13266404/68‑1 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGGTTCATTGCGTAAc > 1:5316483/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCATCCCCTTGCCATTGAATGGTGTAGGTTTCATTGCGTaa > 1:30123230/1‑67 (MQ=255) ccTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgcca > 1:17693035/1‑67 (MQ=255) ggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccag > 1:13394094‑M2/23‑67 (MQ=255) cTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccag < 1:2008321/67‑1 (MQ=255) cTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccag < 1:8165531/67‑1 (MQ=255) cTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccag < 1:21371026/67‑1 (MQ=255) gcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGaa > 1:24204574‑M2/18‑68 (MQ=255) gcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGaa > 1:34690631‑M2/18‑68 (MQ=255) GCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGaa < 1:23264080‑M1/68‑1 (MQ=255) cccGCCATGTGGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGaaa > 1:27971680/1‑68 (MQ=255) CCCGACATGTCGGGCCTTCCCCGTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGaaa < 1:9498022‑M1/68‑1 (MQ=255) catgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGt < 1:25410533‑M2/56‑1 (MQ=255) catgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGt > 1:38344696‑M2/12‑67 (MQ=255) CATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGt < 1:23756246‑M1/67‑1 (MQ=255) atgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGt > 1:1232036‑M2/11‑66 (MQ=255) atgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGt > 1:1388713‑M2/11‑66 (MQ=255) atgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGc < 1:32592972‑M2/58‑1 (MQ=255) ATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGt < 1:15076217‑M1/66‑1 (MQ=255) ATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGt < 1:34409036‑M1/66‑1 (MQ=255) cgggcgTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGATTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg < 1:7110191‑M2/61‑1 (MQ=255) cgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg < 1:38928680‑M2/61‑1 (MQ=255) cgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg < 1:24518166‑M2/61‑1 (MQ=255) cgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg < 1:5872481‑M2/61‑1 (MQ=255) CGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCgg < 1:3688089‑M1/68‑1 (MQ=255) CGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg > 1:31418036‑M1/1‑67 (MQ=255) gggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGt < 1:29783827‑M2/63‑1 (MQ=255) gggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGt < 1:15491641‑M2/63‑1 (MQ=255) GGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGt > 1:36543579‑M1/1‑68 (MQ=255) gccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCCTTGCGTAACGCCAGCCAGAAATCGTGCTCGGTa < 1:19272854‑M2/64‑1 (MQ=255) GCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTaa < 1:7909663‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTaa < 1:26530163‑M1/68‑1 (MQ=255) cTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTAAAg > 1:14722305‑M2/2‑68 (MQ=255) cTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTAAAg > 1:24997324‑M2/2‑68 (MQ=255) ttCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTAAAgg < 1:31774219/68‑1 (MQ=255) | CGATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTAAAGG > CP009273/1237984‑1238118 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |