| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1870380 | 282 (0.590) | 15 (0.040) | 9/94 | NT | 5.8% | coding (451/1182 nt) | yeaN | putative transporter |
| ? | CP009273 | = 1870397 | 251 (0.630) | coding (468/1182 nt) | yeaN | putative transporter | |||||
Only 100 of 470 total aligned reads displayed.
CGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCT > CP009273/1870331‑1870462 | cAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtg > 1:15985330‑M2/1‑64 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:7671927‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:26727795‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:15326750‑M2/66‑6 (MQ=255) cTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgct > 1:33001220‑M2/1‑60 (MQ=255) cTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:5624049‑M2/65‑6 (MQ=255) ttACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctg < 1:29502234‑M2/68‑10 (MQ=255) gcATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGa < 1:29959584/67‑1 (MQ=255) atatTCCCTGACAATGGGAGCTGCTGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACg < 1:39597998/68‑1 (MQ=255) atatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACg > 1:8666489/1‑68 (MQ=255) tatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACgg < 1:9787488/68‑1 (MQ=255) tatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACgg < 1:19873332/68‑1 (MQ=255) tatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACgg < 1:17818551/68‑1 (MQ=255) tatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACgg < 1:21477176/68‑1 (MQ=255) tatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACgg < 1:3285932/68‑1 (MQ=255) tatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACgg < 1:3942077/68‑1 (MQ=255) tatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACgg < 1:5163503/68‑1 (MQ=255) tatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACgg < 1:6855253/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGATCGGt > 1:22937728/1‑68 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:33217840/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:16793814/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:11809755/68‑1 (MQ=255) ttCCCTGCCAATGGGCGCTGCACCGGCACGGGGATCGGCTATGGTCgtgccgcggcagctcccattgt > 1:24084921‑M2/1‑46 (MQ=255) ttCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGtt < 1:32700181/68‑1 (MQ=255) ccTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGTATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGATTTGAACCGTTTtg > 1:2326753/1‑68 (MQ=255) ccTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctgcagctcccattgtcag > 1:10443231‑M2/1‑43 (MQ=255) cTGCCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtgg < 1:22457234/68‑1 (MQ=255) tGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:24420955/1‑66 (MQ=255) tGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:37582791/1‑66 (MQ=255) tGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:3868697/1‑66 (MQ=255) gACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:24596162/1‑65 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:11455699/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:37235816/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:13389023/1‑68 (MQ=255) aaTGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctggc > 1:27877192/1‑68 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:25424814/1‑67 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:20063098/1‑67 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:2198278/1‑67 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:31989460/1‑67 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:19094228/1‑67 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGGTTTGGCTGGCAAg > 1:4234529/1‑67 (MQ=255) aGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgc > 1:28706575/1‑67 (MQ=255) gCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgcg < 1:3032780/67‑1 (MQ=255) cTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGcgcg > 1:13689177/1‑68 (MQ=255) gCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGtt > 1:17142750/1‑68 (MQ=255) AGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGtt < 1:31489672‑M1/66‑1 (MQ=255) AGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGtt < 1:38776220‑M1/66‑1 (MQ=255) AGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGtt < 1:27024788‑M1/66‑1 (MQ=255) AGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTg > 1:15093124‑M1/1‑67 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:62234‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:32400787‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:32176374‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:20699642‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:14666112‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:35612846‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:29288854‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:3506733‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:19457484‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTc > 1:12067785‑M1/1‑67 (MQ=255) CACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt > 1:27500135‑M1/1‑67 (MQ=255) CACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt > 1:11151299‑M1/1‑67 (MQ=255) CACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt > 1:14223522‑M1/1‑67 (MQ=255) CACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt < 1:17476096‑M1/67‑1 (MQ=255) ACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt < 1:24729151‑M1/66‑1 (MQ=255) CTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCt > 1:7182715‑M1/1‑68 (MQ=255) gggATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGa > 1:9259375/1‑68 (MQ=255) gggATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGCCGCGTTGCTCATGCTGa < 1:27246086/68‑1 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:34269618/1‑68 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:24283320/1‑68 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:7459030/1‑68 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:12944502/1‑68 (MQ=255) tCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGTCTGTCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgt < 1:23700439/67‑1 (MQ=255) tCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgtg > 1:25836090/1‑68 (MQ=255) tCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgt < 1:12717753/67‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:36926408/68‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:26568793/68‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:18140684/68‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCGGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:3619055/68‑1 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGTTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:666618/1‑68 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:14101035/1‑68 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:12436725/1‑68 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:38530472/1‑68 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:30924445/1‑68 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:25300651/1‑68 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGATCATGCTGATGTGttt > 1:2623292/1‑68 (MQ=255) cTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:5096523/1‑67 (MQ=255) tATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGtttt < 1:37976746/67‑1 (MQ=255) ggTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:16497999/1‑66 (MQ=255) ggTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctc < 1:15547361/68‑1 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:8041410/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:13851195/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:16304643/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:20479914/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:18533003/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCCCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTCCTCATGCTGATCAGTTTTcc > 1:33793352/1‑65 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:10133149/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:23824410/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:18782872/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTATTTTCctct > 1:9588122/1‑67 (MQ=255) cGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:4576645/1‑66 (MQ=255) | CGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCT > CP009273/1870331‑1870462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |