| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3614228 | NA (NA) | 12 (0.030) | 9/90 | NT | 100% | coding (1677/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3614368 | 0 (0.000) | coding (1817/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 377 total aligned reads displayed.
ACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGCAG > CP009273/3614308‑3614435 | acacGCCGGGCCATGAAACGCGGTATGAAAACAACATCGCCGGTGCCCTGACCGCCGTCATctgcccg > 1:11952812‑M2/1‑61 (MQ=255) ggTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcttaacgg < 1:9789243‑M2/68‑29 (MQ=255) acaTCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccg < 1:27569960‑M2/68‑41 (MQ=255) accGCCGTCATctgccctaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:29055572‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:989031‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:20211793‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:25028457‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:26133651‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:27230148‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:31023041‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:3275229‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:32892229‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:33637765‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:34959990‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:35159855‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:37263423‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:37703652‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:38429981‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:39622034‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:5629365‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:6523814‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:9052029‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc < 1:36491235‑M2/67‑57 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:6957329‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:7079689‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatgggcataacgtgttacataacaggaacactcggtgaagct < 1:3247758‑M2/68‑58 (MQ=255) ccgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctc > 1:10247047‑M2/1‑10 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:34097787‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:31539331‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:32941247‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:14448320‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:12319543‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:24703470‑M2/1‑9 (MQ=255) ccccgtcATccgcccgaagcggtcatggtcttaacgggaaaaataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:38689579‑M2/3‑9 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:34578828‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:30945736‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:14114617‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:27705338‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:18050720‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:13741891‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:4253763‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:26449386‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:18837935‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:13441354‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:5816064‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:32099818‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:11682048‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:22788147‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:1473764‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:22055601‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:21590875‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttaaataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:19050655‑M2/67‑60 (MQ=255) gCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTAC > 1:28428500‑M2/1‑68 (MQ=255) ccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgg > 1:35642925‑M2/1‑7 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctccgca < 1:24286061‑M2/68‑63 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca > 1:16636556‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:30790767‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:8632544‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcgggcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca > 1:29889775‑M2/1‑6 (MQ=255) cGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCA > 1:7729284‑M2/1‑68 (MQ=255) ggcatTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAC > 1:10653192‑M2/3‑68 (MQ=255) gTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaa > 1:37569839‑M2/1‑5 (MQ=255) gTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAC > 1:29814551‑M2/1‑68 (MQ=255) gTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAC > 1:29643456‑M2/1‑68 (MQ=255) gTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAC > 1:17977328‑M2/1‑68 (MQ=255) gTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAC > 1:32235898‑M2/1‑68 (MQ=255) gTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAC > 1:23154241‑M2/1‑68 (MQ=255) gTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAC < 1:22116302‑M2/68‑1 (MQ=255) gTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGGGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAC > 1:17690654‑M2/1‑68 (MQ=255) gTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACAAAGTCCGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAC < 1:19233326‑M2/68‑1 (MQ=255) aTctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaact < 1:15608472‑M2/67‑66 (MQ=255) aTTGCCCCGGACGGCAGCCGAAACGGGACACAGTACGAGGCGGGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGC > 1:26618867‑M2/1‑67 (MQ=255) ttGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGCAt > 1:14972993‑M2/1‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtgataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:12931097‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:1521054‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:10031433‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:196756‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:923752‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:20990157‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:22393825‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:23958746‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:6725927‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:25494781‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:25655094‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:5101984‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:5044437‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:18490944‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:2802759‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:31126960‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:17022157‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:36073050‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:4486184‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:4084516‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:39153728‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:37975840‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:23387642‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:16035163‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:11199541‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:34803951‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:1552325‑M2/67‑67 (MQ=255) | ACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGCAG > CP009273/3614308‑3614435 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |