| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3614731 = | NA (NA) | 7 (0.020) | 6/98 | NT | 100% | coding (2180/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | 3614737 = | 0 (0.000) | coding (2186/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACC > CP009273/3614670‑3614804 | cggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgt < 1:33544454‑M2/1‑1 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc < 1:10724263‑M2/2‑1 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc < 1:37328941‑M2/2‑1 (MQ=255) ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:22577284‑M2/67‑68 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:30492592‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:9205734‑M2/3‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:511135‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:23935579‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:12480665‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:14437782‑M2/65‑67 (MQ=255) ctttctcatcatacctttaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:33935304‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:9277306‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:13020897‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:35053671‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:36567612‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:3677501‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:29813247‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg > 1:4902773‑M2/64‑67 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:25887933‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:24831117‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:5070225‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:22882715‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg > 1:5109525‑M2/64‑67 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:21385223‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:5914691‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:7955404‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:16752079‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg > 1:8434991‑M2/64‑67 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:11231085‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGc < 1:23578071‑M2/5‑1 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:5189655‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:38197102‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:7790333‑M2/6‑1 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:8005805‑M2/6‑1 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:9386667‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:32140382‑M2/6‑1 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:16379992‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:28826257‑M2/6‑1 (MQ=255) ttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCa < 1:34835354‑M2/7‑1 (MQ=255) ttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCa < 1:25910296‑M2/7‑1 (MQ=255) tctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCa > 1:7125331‑M2/61‑67 (MQ=255) tctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCa > 1:4038109‑M2/61‑67 (MQ=255) catacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGc < 1:17326703‑M2/14‑1 (MQ=255) ctgaaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatggctgTCAGCCATATCAGCGAAgg < 1:6963545‑M2/19‑1 (MQ=255) gtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGc < 1:16921985‑M2/21‑1 (MQ=255) gcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCgg < 1:6019227‑M2/26‑1 (MQ=255) gcaccgccacccggtgcccttcgctgatatgcctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCgg < 1:17764170‑M2/26‑1 (MQ=255) acccggtgccctccgctcatatggctgatggcggCCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGt < 1:39291944‑M2/34‑1 (MQ=255) ctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAg > 1:20477587‑M2/11‑67 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAGAGGCCGGCTGAcc < 1:16320447‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:12344061‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:17288890‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:16073342‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:16027300‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:15586670‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:24122627‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:3766087‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:28913071‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:10578867‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:32647232‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAACGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:430041‑M2/68‑1 (MQ=255) | CACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACC > CP009273/3614670‑3614804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |