| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4583141 = | NA (NA) | 8 (0.020) | 4/90 | NT | NA | intergenic (+12/+37) | tsr/yjjL | methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor/L‑galactonate transporter |
| ? | CP009273 | 4583171 = | NA (NA) | intergenic (+42/+7) | tsr/yjjL | methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor/L‑galactonate transporter | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4583218‑4583141‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttatcgggcatAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAGTGCC > CP009273/4583171‑4583235 TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCT < 1:14286022/68‑1TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCT < 1:13635254/68‑1 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:18676028/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:4699353/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:28261133/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:7420233/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:7649892/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |