| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 725679 | NA (NA) | 4 (0.010) | 4/100 | NT | NA | coding (641/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | = 725702 | NA (NA) | coding (664/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725608‑725679‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtggaACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG < CP009273/725702‑725637 cCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:17262079/67‑1GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:8503362/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:18941235/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:29559645/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:17653526/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:3052429/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:26725101/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:23889055/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTG < 1:30508907/67‑1 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGGTGGT > 1:19168896/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:25504089/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:30131543/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:17547637/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:24111574/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:19225484/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:30803914/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:19888530/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:13728892/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:33470449/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:13540430/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCAGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:11214289/1‑68 GGGTGCCGTAAGATGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:34873458/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTGCTGACCGGGCTGGT < 1:22056187/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:28089659/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:20199668/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:26038642/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:22503211/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:30457038/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:15005746/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:30664188/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:14170737/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:12134923/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:12037127/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:11815022/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:28910829/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:3656572/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:4286674/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:24744168/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:4753231/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:6629762/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:8650628/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:10484388/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:17076762/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:1900826/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:21139064/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:13218000/66‑1 ggGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:22183906/65‑1 gaGCCGGAAGCGGATGAGGTGCGGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:26963976/65‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:18034663/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:18075911/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:28344252/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:34349860/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:28059112/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:20682175/67‑1 TGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA > 1:22533474/1‑67 TGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA < 1:32044804/67‑1 TGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA > 1:4651379/1‑67 TGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA < 1:21536255/67‑1 TGCCGGAAGAGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA > 1:5632018/1‑67 CGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGT < 1:3447340/68‑1 CGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGT < 1:32763745/68‑1 AGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGT < 1:28192536/68‑1 TGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCG < 1:2596647/68‑1 TGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:27932396/68‑1 CGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGGCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAG < 1:33691404/68‑1 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTATGGCGGCAGCGGC > 1:1230239/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:31905560/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:23551285/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:13583471/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:8148951/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:1169418/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:34227302/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:34687318/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:14306311/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:1473570/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |