New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 725724 | NA (NA) | 20 (0.060) | 9/94 | NT | NA | coding (686/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
? | CP009273 | = 725738 | NA (NA) | coding (700/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725649‑725724 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccggtgaTTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAG < CP009273/725738‑725672 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:31784199/68‑1 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:20041312/68‑1 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:2247391/68‑1 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:14999659/68‑1 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:27293343/68‑1 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:27788671/68‑1 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:32971889/1‑67 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:32177057/1‑67 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:22911838/1‑67 CGTACGGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:33321169/68‑1 CGTACCGGGTACTGCCCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGGTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:13804088/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:29859430/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:22238080/68‑1 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:19733386/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:1722858/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGc < 1:24458368/67‑2 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:20871620/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:5645469/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:28130777/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:8416499/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:179783/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:30524305/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:636848/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:6566896/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:23827364/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:4115254/67‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:33537282/68‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:3422907/68‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:26811239/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:18665945/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:15880502/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGGTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:15228434/68‑1 ACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCa > 1:16509975/1‑67 CGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGGGGTTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGGGGAACG > 1:16998259/1‑64 CACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGC > 1:379808/1‑68 CGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGGACGTCTGTGTGCGC > 1:22046655/1‑67 CGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGATCGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:27400897/1‑68 CGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:12874732/1‑68 CGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:24707856/1‑68 gctGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:21656318/4‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGACCGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:29691014/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:30119617/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:12380816/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:7772268/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:28575262/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:34855213/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:8330249/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:1008633/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:26426550/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:34679029/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:11232313/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:11011611/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:9170030/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:32702091/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:33058939/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:19541921/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:20205034/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:21185897/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:16797221/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:22636965/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:23557560/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:4551992/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:24566712/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:25462071/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:7113465/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:1299022/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:14172926/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:31598731/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:20724431/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:10361155/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCG‑CCGAAGCGGT > 1:25863909/1‑67 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCCCCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:34586403/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:6776043/68‑1 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CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:13748216/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:15509490/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:15675520/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:16056587/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:25810090/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:28810207/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:29568180/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:30771267/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:31527785/68‑1 CGGTGATTGCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGGGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:2173922/68‑1 CGGTGATGTCGCCGCAGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:23978069/68‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |