| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3613137 | NA (NA) | 8 (0.020) | 5/98 | NT | NA | coding (586/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3613192 | NA (NA) | coding (641/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3613065‑3613137‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaagcggTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCGGC < CP009273/3613192‑3613127 CGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGA < 1:18670560/68‑1CGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGA < 1:5696818/68‑1CGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGA < 1:20629328/68‑1CGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGA < 1:32550423/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:632539/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:24550779/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCGCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:4968684/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGGGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:18297529/68‑1 TATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGC > 1:2518929/1‑68 agCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:1035348/66‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCTGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:1077115/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:31172663/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:30889705/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > 1:30511466/1‑68 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:28757517/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:28338575/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:2753101/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:33523549/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > 1:5360866/1‑68 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:24504670/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:24214049/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:23059753/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:21605028/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:19696537/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:6172084/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:8579059/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:1119107/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:15210780/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:13874157/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:15616807/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:15934270/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:13576242/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:16106288/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:10911319/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:13127582/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGCGCCGGAAGCG < 1:3597101/68‑1 TCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:17098931/68‑1 TCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:8162462/68‑1 TCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG > 1:33870623/1‑68 TCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:11838022/68‑1 TCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGGGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:33240092/68‑1 GGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCC < 1:10574686/68‑1 GGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCC < 1:27181815/68‑1 GGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCC < 1:19337024/68‑1 CGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGTGC‑‑‑‑GCCCGAAGCGGTCCACCAG < 1:6631608/67‑1 CGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCCA < 1:1581741/67‑1 CCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCCACCAGCCCGGT < 1:8521153/66‑1 CCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:33921395/65‑1 CCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGGTGGTGGGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:3345587/65‑1 GCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:22087262/68‑1 CGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGT < 1:17387181/67‑1 CGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGT < 1:27014711/67‑1 GCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGC < 1:3285834/68‑1 AAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTT > 1:19839620/1‑67 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCCGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:6747169/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCCTCCGCTTCC > 1:34046516/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:14629807/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:33908431/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:6916438/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:11535814/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:6657925/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:32975107/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:10604063/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:12128205/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:365373/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:21554762/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:22442528/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:30489148/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:29524240/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:29480556/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:29401250/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:22678497/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:22894174/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:28365563/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:5999094/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:14063026/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:24914571/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:10679297/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:5891316/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTC < 1:17415583/67‑1 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTC < 1:31001167/67‑1 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTC < 1:13238692/67‑1 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTC < 1:19273756/67‑1 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTC < 1:16109811/67‑1 GCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCG > 1:4046966/1‑68 GCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCG > 1:843081/1‑68 GCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACCGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCCCCTCATCCGCTGCCG > 1:21204066/1‑68 CGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGGACCTCATCCGCTTCCG > 1:1973676/1‑67 CGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCCCCTCATCCGCTTCCG > 1:557793/1‑67 CGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCG > 1:21453624/1‑67 CGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCG > 1:10179745/1‑67 CGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCG > 1:18237030/1‑67 CGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCG > 1:16330455/1‑67 CGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCG > 1:1887775/1‑67 CGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCG > 1:15411686/1‑67 CGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCG > 1:26247765/1‑67 CGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCG > 1:28862635/1‑67 CGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCG > 1:33125852/1‑67 CGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCAACCGCTTCCG > 1:24920808/1‑67 GTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCGGC > 1:33313972/1‑67 CGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3613065‑3613137‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaagcggTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCGGC < CP009273/3613192‑3613127 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |