| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4501871 = | 236 (0.570) | 24 (0.070) | 8/92 | NT | 6.9% | coding (361/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit |
| ? | CP009273 | 4501966 = | 453 (1.320) | coding (266/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit | |||||
Only 100 of 578 total aligned reads displayed.
CAGCACCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCAC > CP009273/4501899‑4502033 | aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAac > 1:33844865/1‑68 (MQ=255) aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAac < 1:29087972/68‑1 (MQ=255) ccATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAaca < 1:18684902/68‑1 (MQ=255) aTCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACAcc < 1:8510856/68‑1 (MQ=255) cACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCga < 1:10619400/68‑1 (MQ=255) cACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCga < 1:22884484/68‑1 (MQ=255) ttatgccgtcactgcccgtgatggtgctgccgctgctggcctttgcgggcggcatggTTAACACCgag < 1:34593433‑M2/11‑1 (MQ=255) ttatgccgtcactgcccgtgatcgtgctgccgctgctggccgttgcgggcggcatggTTAACACCgag < 1:30285424‑M2/11‑1 (MQ=255) aCGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCgag > 1:6190946/1‑68 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa > 1:17436386/1‑68 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa < 1:25612101/68‑1 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa > 1:25872665/1‑68 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa > 1:13491619/1‑68 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa > 1:1550683/1‑68 (MQ=255) atgccgtcactgcccgtgatggtgctgccgctgctggcctttgcgggcggcatggTTAACACCGAGaa < 1:10003036‑M2/13‑1 (MQ=255) tgccgtcactgcccgtgatggcgctgccgctgctggcctttgcgggcggcatggTTAACACCGAGAat < 1:2702398‑M2/14‑1 (MQ=255) tgccgtcactgcccgggacggtgctgccgcggcccgcctttgcgggcggcatggTTAACACCGAGAat < 1:23549201‑M2/14‑1 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:27834435/1‑68 (MQ=255) cAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata < 1:19672542/67‑1 (MQ=255) cAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata < 1:24719053/67‑1 (MQ=255) aGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAatat > 1:16900120/1‑67 (MQ=255) gACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATcc < 1:21151218/66‑1 (MQ=255) aCGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGt > 1:13255631/1‑68 (MQ=255) cATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAt < 1:22334541/67‑1 (MQ=255) ccgtgatggtgctgccgctgcgggcctgtgcgggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:18325685‑M2/25‑1 (MQ=255) ccgtgagcgggctgccgcggctggcctttgcgggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:30765191‑M2/25‑1 (MQ=255) ccgggatggtgctgccgctgctggcctttgcgggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:6550319‑M2/25‑1 (MQ=255) aTAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:5197767/67‑1 (MQ=255) aTAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:17097984/67‑1 (MQ=255) aTAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:21713142/67‑1 (MQ=255) aTAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:9641030/67‑1 (MQ=255) tAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:4999930/68‑1 (MQ=255) tAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:26204074/68‑1 (MQ=255) agaagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCag < 1:21442756/68‑1 (MQ=255) agaagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCag > 1:10397897/1‑68 (MQ=255) agaagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCag > 1:12918297/1‑68 (MQ=255) gaagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCaga > 1:32444928/1‑68 (MQ=255) aagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGGGAATATCCGGTGATGCCagag > 1:15013994/1‑68 (MQ=255) aagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCagag > 1:15203637/1‑68 (MQ=255) aagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCagag > 1:28936134/1‑68 (MQ=255) agTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAgg < 1:15634547/68‑1 (MQ=255) agTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAgg < 1:33083003/68‑1 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:1579294/1‑68 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:1788766/1‑68 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:4383980/1‑68 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:12180188/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:2032539/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:15971462/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:8149858/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:20609351/67‑1 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:20916836/67‑1 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:31747577/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:30918665/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:21895249/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:6486577/1‑68 (MQ=255) cccccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgcgc > 1:5788891/1‑68 (MQ=255) ccccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgcgc < 1:4046513/67‑1 (MQ=255) ccccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgcgc > 1:16400022/1‑67 (MQ=255) ccccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgcgc < 1:22645582/67‑1 (MQ=255) cccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGcac < 1:19974706/68‑1 (MQ=255) cacaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACaa > 1:29974054/1‑68 (MQ=255) ccaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt < 1:14733503/67‑1 (MQ=255) acaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACaa > 1:28661694/1‑67 (MQ=255) acaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt < 1:11060771/68‑1 (MQ=255) acaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt < 1:26654097/68‑1 (MQ=255) caGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACCCCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt > 1:1255019/1‑67 (MQ=255) caGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt > 1:14154117/1‑67 (MQ=255) caGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt > 1:5519247/1‑67 (MQ=255) caGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt > 1:24352605/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:34260391/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:7381808/1‑67 (MQ=255) gagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGc > 1:29551687/1‑47 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:14013961/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:9431814/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:11933963/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:11565138/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:11754602/1‑65 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:32066222/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:31423996/65‑1 (MQ=255) ccAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt > 1:144561/1‑68 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:34044052/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:8889121/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:22143596/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:28244544/67‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATc > 1:19340032/1‑68 (MQ=255) ggCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATc > 1:33436603/1‑68 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcccc > 1:6835401/1‑60 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:23211525/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:13072332/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:7143680/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:24953998/1‑67 (MQ=255) cggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAc < 1:27449789‑M2/59‑1 (MQ=255) cggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAc > 1:31286554‑M2/9‑67 (MQ=255) ggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcg > 1:18945304‑M2/8‑67 (MQ=255) gcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcgc > 1:24114627‑M2/7‑67 (MQ=255) catggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcgccc > 1:16173643‑M2/6‑68 (MQ=255) tggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcgcccgc < 1:29273083‑M2/65‑1 (MQ=255) tggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcgcccg > 1:18538267‑M2/4‑67 (MQ=255) tggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcgcccg > 1:8668997‑M2/4‑67 (MQ=255) ggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcgcccgcc > 1:3769642‑M2/3‑68 (MQ=255) | CAGCACCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCAC > CP009273/4501899‑4502033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |