| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 610426 | 163 (0.390) | 19 (0.050) | 6/96 | NT | 11.1% | coding (814/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| ? | CP009273 | = 610453 | 166 (0.460) | coding (841/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent | |||||
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
GGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTGCGGCGCA > CP009273/610388‑610520 | gCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:3464150‑M2/67‑3 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:26194078‑M2/68‑5 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:28571961‑M2/68‑5 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:29931584‑M2/68‑5 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:16545297‑M2/68‑5 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:13943147‑M2/68‑5 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:9329714‑M2/68‑5 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:8621388‑M2/68‑5 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:19068645‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:8200643‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:10920871‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc < 1:21286561‑M2/67‑8 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:13094236‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:17478648‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:5107486‑M2/1‑60 (MQ=255) gCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTaggcggc < 1:25693321‑M2/66‑8 (MQ=255) cGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGgcgc < 1:24300071/67‑1 (MQ=255) cGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGgcgc < 1:27167078/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:22954998‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:21591523‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:21394134‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:18025904‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGa < 1:14995121/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGa < 1:33458061/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGAc < 1:5479820/68‑1 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:21969557‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:32722224‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:24005319‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:33794826‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:11881692‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:11371900‑M2/1‑54 (MQ=255) gtgCAATCGTATGGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:34059089‑M2/1‑54 (MQ=255) gtgCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACgg < 1:16068515/68‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGc < 1:12561495/67‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGc < 1:6032017/67‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt < 1:8405583/68‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt < 1:7036093/68‑1 (MQ=255) cAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCGCGGCGGCGCTGACGGCt < 1:21435233/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacg > 1:17324004‑M2/1‑49 (MQ=255) aaTCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGcaa > 1:3233853/1‑65 (MQ=255) aaTCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:30271136/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:19747359/67‑1 (MQ=255) cGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:29361989/1‑68 (MQ=255) cGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:22789620/1‑68 (MQ=255) cGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:12354219/1‑68 (MQ=255) cGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:7298404/1‑68 (MQ=255) aTGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacgattgc > 1:26151389‑M2/1‑43 (MQ=255) aTGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGAcc < 1:24501713/68‑1 (MQ=255) aTGG‑ACAACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGCCTGGGCTcggcggcgtagtccatacgattgc > 1:24534091‑M2/1‑43 (MQ=255) gg‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:3679515/1‑68 (MQ=255) gg‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:25839729/1‑68 (MQ=255) gg‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:5538911/1‑68 (MQ=255) gg‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:11163046/1‑68 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:10174198/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:27477537/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:31319939/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:4056570/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:33229963/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:3870187/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:3761721/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:18727765/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:11583669/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:19700028/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:2317970/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:12795140/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:13670029/67‑1 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:4560458/1‑66 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGc < 1:6804077/68‑1 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa > 1:21566752/1‑67 (MQ=255) ccgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc > 1:10525139/1‑68 (MQ=255) ccgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc > 1:2505267/1‑68 (MQ=255) ccgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc > 1:236986/1‑68 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:26721068/67‑1 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:31438141/67‑1 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:12125928/67‑1 (MQ=255) gccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGt < 1:22293467/68‑1 (MQ=255) gATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGtttt > 1:7975386/1‑67 (MQ=255) tttATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGc < 1:20777061/67‑1 (MQ=255) tCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTg > 1:23303659/1‑68 (MQ=255) cTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg > 1:32873912/1‑68 (MQ=255) cTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg < 1:21191579/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:18683508/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:15640248/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:15233057/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACAGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:65334/68‑1 (MQ=255) tttATGCGGCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:5965099/68‑1 (MQ=255) ttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGt < 1:9945557/68‑1 (MQ=255) tATGCGTCGACTGGGCGCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTa < 1:20438980/68‑1 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAtt < 1:1923639/68‑1 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAtt < 1:31833386/68‑1 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAtt < 1:29286510/68‑1 (MQ=255) gCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTc < 1:18460078/68‑1 (MQ=255) gCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTc < 1:25418860/68‑1 (MQ=255) gTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTcac < 1:9211906/68‑1 (MQ=255) gTCGACTGGGCGCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTcac < 1:25212109/68‑1 (MQ=255) cTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTga > 1:25516386/1‑67 (MQ=255) ggCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTgcggc < 1:17770413/68‑1 (MQ=255) gCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTgcggc < 1:10047106/67‑1 (MQ=255) tCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTGCGgcgc < 1:14753734/67‑1 (MQ=255) tCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTGCGGCGCa > 1:13385399/1‑68 (MQ=255) | GGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGG‑ACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTGCGGCGCA > CP009273/610388‑610520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |