| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3614731 = | NA (NA) | 8 (0.020) | 7/98 | NT | 100% | coding (2180/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | 3614737 = | 0 (0.000) | coding (2186/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
ACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACC > CP009273/3614671‑3614804 | ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc < 1:34152309‑M2/2‑1 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc < 1:21955371‑M2/2‑1 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:30425273‑M2/67‑68 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc < 1:3288890‑M2/2‑1 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:32519241‑M2/67‑68 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:4076043‑M2/3‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:25964270‑M2/3‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:28536362‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:34588104‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:20515140‑M2/3‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:17266967‑M2/3‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:6459762‑M2/3‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:14290585‑M2/3‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccgctgcccatcgctgatatcgctgatgtctcTCa > 1:18769670‑M2/65‑67 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:33186973‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:21553142‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:22197201‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:28392089‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:28370416‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:33912454‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:27490783‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGc < 1:17216917‑M2/5‑1 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:29704428‑M2/6‑1 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:10553264‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:19176038‑M2/6‑1 (MQ=255) ttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCa > 1:23051129‑M2/62‑68 (MQ=255) ttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCa < 1:20577336‑M2/7‑1 (MQ=255) tctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCat < 1:19649901‑M2/8‑1 (MQ=255) tacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgGCAGCCATATCAGCGa < 1:29204244‑M2/16‑1 (MQ=255) gtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatggctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGc < 1:33094029‑M2/21‑1 (MQ=255) gtaatgcaccgccacccggggcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGc < 1:27576438‑M2/21‑1 (MQ=255) tgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCg > 1:1977712‑M2/44‑58 (MQ=255) gcacccccccccggtgcccttcgctgatagggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCgg < 1:33922915‑M2/26‑1 (MQ=255) acccccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgcctgTCCGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGt < 1:15171064‑M2/28‑1 (MQ=255) tcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTa > 1:21161127‑M2/23‑68 (MQ=255) tatggctgctgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACAGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATgag > 1:25157977‑M2/16‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGCAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:34122091‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:5831624‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:6085320‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:13866009‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:33517229‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:2938281‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:27867475‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:2538447‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:20447766‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:14425020‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGCGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:8980697‑M2/68‑1 (MQ=255) | ACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACC > CP009273/3614671‑3614804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |