| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3630213 | 314 (0.750) | 50 (0.160) | 22/84 | NT | 18.2% | coding (558/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase |
| ? | CP009273 | = 3630199 | 214 (0.680) | coding (572/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase | |||||
Only 100 of 444 total aligned reads displayed.
AGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCGACGC > CP009273/3630132‑3630266 | aGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCa > 1:29154439/1‑68 (MQ=255)aGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCa > 1:16786851/1‑68 (MQ=255) gCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAG > 1:5080908‑M1/1‑67 (MQ=255) cACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAga < 1:13714376‑M2/67‑3 (MQ=255) cACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA < 1:1037391‑M1/67‑1 (MQ=255) cACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA > 1:15592339‑M1/1‑67 (MQ=255) cACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGGGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCGCCAGACCCGCGC > 1:4936157‑M1/1‑68 (MQ=255) cACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGC > 1:17277734‑M1/1‑68 (MQ=255) cACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGC > 1:19433982‑M1/1‑68 (MQ=255) ccgccAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtc < 1:17645593‑M2/68‑15 (MQ=255) ccAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGgc > 1:18833111/1‑68 (MQ=255) ccgcaCCTGTACCTCTTCGAGCAACGGTTTATCCAGAGCGAATGGCACCAGCCCCGCGCGGGTCtggt < 1:18452428‑M1/66‑5 (MQ=255) cAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggt > 1:23476239‑M2/1‑50 (MQ=255) cAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggt < 1:5651551‑M1/68‑5 (MQ=255) aGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGgca > 1:4563841/1‑67 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGCGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgcca > 1:25740455‑M2/1‑46 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgcca > 1:21111603‑M1/1‑60 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgc < 1:8298215‑M1/66‑7 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCAc > 1:25907054/1‑68 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCAc > 1:27551081/1‑68 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCCCGGGTCGGCAGCAc > 1:12098154/1‑68 (MQ=255) cTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGt > 1:269672/1‑68 (MQ=255) cTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGt > 1:27973157/1‑68 (MQ=255) atGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGCGTCGGCAGCACGt > 1:22735798/2‑68 (MQ=255) tGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGtt > 1:6656652/1‑68 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAGTGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcac > 1:20400624‑M2/1‑40 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcac > 1:31862200‑M2/1‑40 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcac > 1:20529868‑M2/1‑40 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAg > 1:24694645/1‑68 (MQ=255) aCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAg > 1:30071262/1‑67 (MQ=255) aCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAg > 1:7301877/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCCGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:3302599/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgagcgggtgtggtgccattgac < 1:31491875‑M2/65‑28 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:33834960/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:6025978/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:21165067/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:28441280/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:1119597/1‑67 (MQ=255) tctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGcc > 1:25995292/1‑68 (MQ=255) tctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGcc > 1:23218251/1‑68 (MQ=255) ctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgc > 1:29703837‑M2/1‑36 (MQ=255) ttCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCaa > 1:9847848/1‑68 (MQ=255) tCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcat > 1:17150617‑M2/1‑34 (MQ=255) aGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTg > 1:10587440/1‑68 (MQ=255) aaCGGTTTATGCAGAGTGAATGCCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaacc > 1:9620161‑M2/1‑28 (MQ=255) ttATGCCGCGTGAAGGGCACCAgccccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgct > 1:28036028‑M2/1‑22 (MQ=255) ttATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgct > 1:16036233‑M2/1‑22 (MQ=255) tATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATc < 1:285749/68‑1 (MQ=255) tGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactatgcataaaccgttgcgcgaa > 1:15252415‑M1/1‑33 (MQ=255) tGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGTCCAAATTGTTCGGCAATCtt > 1:13304765/1‑68 (MQ=255) tGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGGCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaa < 1:32477509‑M1/68‑36 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:1816492/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:30480685/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:17899833/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:33359091/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:3971942/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:2661951/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:14219279/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:19141605/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:7812860/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:10029767/1‑68 (MQ=255) cgagtGAATGCCACCCcacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagag > 1:29491858‑M2/2‑16 (MQ=255) gTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagtt < 1:840790‑M2/67‑55 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagtt > 1:14724512‑M1/1‑27 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAAcc > 1:20031279/1‑68 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAAc > 1:18065430/1‑67 (MQ=255) gAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCaa > 1:23938061/1‑68 (MQ=255) aTGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacagg > 1:25643953‑M1/1‑23 (MQ=255) tGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt < 1:21893194‑M2/68‑61 (MQ=255) tGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt < 1:11356648‑M2/68‑61 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt > 1:17309950‑M1/1‑22 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACg > 1:11915774/1‑68 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACg > 1:19822183/1‑68 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCATATAACCAAACg > 1:24964913/1‑68 (MQ=255) gCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattccctctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt < 1:1280787‑M2/66‑61 (MQ=255) gCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt < 1:14396549‑M2/66‑61 (MQ=255) gCACCAgacccgcgcgggtctggtgccaatcactctgcataaaccgttgctcgaagatttacaggt < 1:8634998‑M2/66‑61 (MQ=255) gCACCAgacccgcgcggggctggtgccattcactctgcataaaccgttgctggaagagttactggt < 1:27754295‑M2/66‑61 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataacccgttgctcgaagagttacaggt > 1:33719276‑M1/1‑20 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt > 1:4235553‑M1/1‑20 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt > 1:3462023‑M1/1‑20 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGGACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGc > 1:23416033/1‑68 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGc > 1:21648939/1‑68 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGc > 1:16253839/1‑68 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGc > 1:12606066/1‑68 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGc > 1:124215/1‑68 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAAACTTATAACCAAACGGc > 1:34255618/1‑68 (MQ=255) aCCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggtgctg < 1:34848748‑M2/68‑65 (MQ=255) 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aCCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCg > 1:31111007/1‑67 (MQ=255) ccAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCGAc > 1:24246651/1‑68 (MQ=255) | AGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCGACGC > CP009273/3630132‑3630266 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |