New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 3832491 = | 392 (0.880) | 21 (0.060) | 7/96 | NT | 8.0% | coding (884/924 nt) | yicL | EamA family inner membrane putative transporter |
? | CP009273 | 3832524 = | 149 (0.390) | coding (917/924 nt) | yicL | EamA family inner membrane putative transporter |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TTTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3832565‑3832491 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgcggcATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT > CP009273/3832524‑3832589 TTTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTG > 1:16907541/1‑68 TTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGG < 1:19527611/68‑1 TTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTG > 1:16831062/1‑67 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC < 1:32469637/68‑1 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC > 1:13112855/1‑68 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC < 1:35982198/68‑1 TAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC > 1:30405815/1‑67 TAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC > 1:18159927/1‑67 AACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGC > 1:14525875/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:17700517/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:18763536/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:20231584/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:9527421/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:29787605/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:25806096/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:8174934/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:9743432/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:14640270/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:31670540/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:24516931/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:3580650/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:12131185/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:36457352/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:13478041/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:11865072/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGCAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:29838857/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:29014168/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:17914128/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:2217100/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:18768978/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:18298382/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:10967329/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:30176459/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:36353015/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:32081306/1‑67 CGGGGGCGCGGGGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:9834212/68‑1 tGTGGCGCGGTTCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:5208392/67‑1 gggGGCGCGTTGCCTGGGTGGTAATTCGCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:5336248/65‑1 gggGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGAGTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:11147579/65‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:7484204/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:22636017/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:29251901/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:814398/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:30459284/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:32487344/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:32530475/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:12700542/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:12934504/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:13127265/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:16896572/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:17354032/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:9826875/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:19426156/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:21264725/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:11990902/68‑1 CGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAA < 1:28872864/67‑1 CGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAA < 1:13216290/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:23486125/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:10598919/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:9507148/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:34994006/67‑1 GCGGTGCCTGGCGGGTAAGTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:12620165/67‑1 GCGGGGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:19294738/67‑1 GCGGGGCCTGGCGGGTAATTCTCACTTCTGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:10179070/67‑1 GGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGA < 1:8612696/68‑1 GGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGA < 1:13124091/68‑1 GGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGA < 1:21669021/68‑1 GGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGAGTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGA < 1:26102495/68‑1 GGTGCCTGGCTGGTAATGCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGA < 1:36698978/68‑1 TGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:28519499/67‑1 CTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATT < 1:28202425/68‑1 CTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATT < 1:9062289/68‑1 CTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAAT < 1:21879222/67‑1 TGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCA < 1:23245120/67‑1 TGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCA < 1:8648725/67‑1 TGGAAATACTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCA < 1:8025870/67‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:20189050/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:21807625/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:25310898/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:2418533/68‑1 GGTAATCCTCACTTCTGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:11454674/68‑1 GTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCAAAAGTGAGAATTACCAGC < 1:20397167/67‑1 TAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCC < 1:7709307/67‑1 ggTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCT > 1:36904747/3‑68 GGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTA > 1:22510005/1‑68 GGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTA > 1:6390804/1‑68 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGAC < 1:10471869/68‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGAC < 1:5705027/68‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGAC < 1:22492701/68‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:28686828/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:24612582/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:23398531/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:15133173/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:11939797/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:11895454/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:9894398/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:32641125/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:30050127/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:25609813/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:22315318/67‑1 TTTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3832565‑3832491 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgcggcATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT > CP009273/3832524‑3832589 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |