| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4328027 = | 217 (0.490) | 20 (0.050) | 11/96 | NT | 7.8% | intergenic (‑281/+44) | adiY/adiA | adi system transcriptional activator/arginine decarboxylase |
| ? | CP009273 | 4328055 = | 290 (0.760) | intergenic (‑309/+16) | adiY/adiA | adi system transcriptional activator/arginine decarboxylase | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
ATTTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4328100‑4328027‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attacgccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTCC > CP009273/4328055‑4328120 ATTTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACA < 1:29840261/67‑1 TACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTAC > 1:10532524/1‑68 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGC < 1:30615923/68‑1 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGC < 1:23362557/68‑1 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGC < 1:36230913/68‑1 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:25626807/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:31229276/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:17663364/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:21402198/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:17261142/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:33429249/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:33768425/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:29849759/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:21997360/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:4204679/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:26238332/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:6185278/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:7303014/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:9482067/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:10360431/1‑67 CCACGTTATCTCCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAACCCCTAATTGTTAAAATAACATTACG > 1:17957675/1‑67 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:33814931/68‑1 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:18893074/68‑1 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAGCCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTGAATAACATTACGCC > 1:34292944/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:26947947/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:10216177/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:30681031/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:30724333/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:14416603/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:3791614/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:4436216/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:5610982/1‑67 GTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:13254503/1‑63 TATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCA < 1:30616530/67‑1 TATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCA < 1:32665041/67‑1 TATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCA < 1:14234540/67‑1 TATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCA < 1:2560370/67‑1 TATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGC‑GAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGC < 1:24057530/68‑1 ATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGC < 1:25591139/68‑1 GCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGA < 1:23371748/67‑1 GAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGT < 1:26885562/68‑1 AAGCGTACCCACTCTTCCGCGGAAGGCGTAATTGTTTAAATCACACTACGCCTTCAGGGGAATAGTGG < 1:10310626/68‑1 AAGCGTAACCACTAATCCGCTCAAGGCGTAATAGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTG < 1:6615209/67‑1 ATTCCCCTGAAGGCGTAATTGTTAAAAAAACATTCCCCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACG < 1:5997184/68‑1 TTCCGCTGAAGGCGAAATTGTTTAAATAACATAACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGC < 1:21900857/68‑1 TCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAAAAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCA < 1:36514701/68‑1 TCCGCTGAAGGCGTAATTGTTAAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCA < 1:30368554/68‑1 TCCGCTGAAGCCGTAATTGTTTAAATAACATTCCGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCA < 1:7204017/68‑1 TCCCCTGAACGCGTAATTGTTAAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCA < 1:14021120/68‑1 CCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCAC < 1:4762390/68‑1 AGGCGTAATTGATTAAAAAACATTCCGCCGTCAGCGTAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGT < 1:14650046/68‑1 cCGTAATTGTTAACATAACCTCACGCCTTCAGCGGAATAGGGGTTACGCTTTCACGCACATAACGAGG < 1:30380555/67‑1 cCGTAATTCTATAAAAAACATTACCCCTTCAGCGGAATAGTGGATACGCTTTCACGCACATAACGTGG < 1:20629906/67‑1 GCGAAACTGTTTAAATAACATTACGCCGTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGG < 1:34839069/68‑1 CGTAATTGTTAAAAAACCATTCCGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGG < 1:4814686/67‑1 CGTAATTGTTAAAAAAACATAACGCCTCCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGG < 1:36878375/67‑1 cCATTACCCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAAT < 1:2871129/67‑1 TTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTC > 1:34335242/1‑68 TTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGT < 1:20289320/46‑1 ACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAG > 1:22717098/1‑68 ACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAG < 1:30991571/68‑1 ACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAG > 1:23205666/1‑68 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGa > 1:18448882/1‑66 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTC < 1:5551582/68‑1 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:1396578/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:35680328/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:1303841/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:4184834/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:34723659/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:13183863/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:5050898/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:16666151/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:10876655/1‑67 GCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGT > 1:23432849/1‑67 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |