| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4512275 = | 325 (0.730) | 27 (0.070) | 10/92 | NT | 7.4% | coding (1637/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
| ? | CP009273 | 4512318 = | 407 (1.110) | coding (1594/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase | |||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4512351‑4512275‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgcatcggTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTCTT > CP009273/4512318‑4512383 CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGC > 1:18004544/1‑68CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGC > 1:1558879/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:7466569/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:1856532/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:5345327/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:16219001/1‑68 TCTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT < 1:1339643/68‑1 TCTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT < 1:21610139/68‑1 TCTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT < 1:34106087/68‑1 aTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CCTTAATCACCGAAGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTCGCGCGT > 1:18078259/2‑67 CTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTGTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:17525821/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:7610335/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:15936040/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:25802810/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:34940538/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT > 1:11478113/1‑67 TGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGC < 1:13349092/68‑1 TGTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGC < 1:6262970/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:26118087/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:27706689/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:23901607/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:4611232/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:13252385/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:19730864/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:1097999/1‑68 TCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAGTCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:10351704/1‑67 TCATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:11506949/1‑67 CATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATC > 1:4252891/1‑68 CATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATC > 1:21452618/1‑68 ATACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG < 1:15177362/68‑1 TACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:35997565/68‑1 TACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:23251283/68‑1 TACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:32009801/68‑1 TACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:5789226/68‑1 TACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:20355587/68‑1 TACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:20580237/68‑1 TACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:24262158/68‑1 TACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:28309669/68‑1 TACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:28076107/68‑1 TACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:20288937/1‑67 TACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:8421980/1‑67 TACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGGGCATCGG < 1:1010649/68‑1 ACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:32584471/1‑67 ACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:22435399/1‑67 ACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:26680772/1‑67 ACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:21816312/1‑67 ACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:17027252/1‑67 ACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:18855557/1‑67 ACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:32259981/1‑67 ACGGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGGGCATCGGT < 1:17242474/68‑1 GGTAAGCATGTTT‑CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:16495722/1‑65 TGTTTCCGTTAATCACCGATGCACGTTGCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGA < 1:13776625/68‑1 CGTTACTCACCGATGCACCTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATG < 1:16465765/68‑1 CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATG < 1:24451265/68‑1 CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATG < 1:18525694/68‑1 CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTGCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATG < 1:15058254/68‑1 GTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATG < 1:10682718/67‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:21574825/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGGGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:22021461/68‑1 ACCGATGCCCGTTTCTCGGGCGTTTCTACGGGCGCGGGCATCGGTTATTAACGAAACATGCTTACCGT < 1:22796907/68‑1 GATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATG < 1:26703377/68‑1 TTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATAAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTG < 1:2719437/68‑1 TTCTACTGGCGCGGGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACT < 1:22141057/67‑1 TGGCGCGTGCATCGGTGATAAACGAAACATGCTTACCGCATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTACCC < 1:36055041/68‑1 gccTCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:13834442/64‑1 cCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACGGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:13794747/66‑1 GCATCGGTTATTAACGAAACATGATTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTTGTAACCTGGTAGG < 1:5476818/67‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGT < 1:29226623/68‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGT < 1:31443959/68‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGT < 1:24699133/68‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:24019770/67‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:35818940/67‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:4460754/67‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |