| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4583141 = | NA (NA) | 10 (0.030) | 7/90 | NT | NA | intergenic (+12/+37) | tsr/yjjL | methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor/L‑galactonate transporter |
| ? | CP009273 | 4583171 = | NA (NA) | intergenic (+42/+7) | tsr/yjjL | methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor/L‑galactonate transporter | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4583218‑4583141‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttatcgggcatAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAGTGCC > CP009273/4583171‑4583235 TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCT > 1:10426662/1‑68TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCT < 1:25217756/68‑1TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCT > 1:36567246/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:13754435/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:36479223/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA < 1:32015167/68‑1 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:32451448/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:11566143/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTAgc > 1:33256895/1‑66 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:15060013/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:30932327/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:32578476/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:34379388/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:27001695/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:22653750/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:7772009/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACATAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:36361451/1‑68 GTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCG > 1:21874284/1‑68 GTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCG > 1:20819062/1‑68 GTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTAATGCCCGATAACAATTTGCTTATCG > 1:36777324/1‑68 TTCGTCAGCGGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTGCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:15617001/1‑68 TTCGTCAGCCGCTCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:18522696/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:24845148/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:28068152/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:29515235/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:25096989/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:9455533/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:34880122/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:35163312/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |