| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 442683 | 353 (0.790) | 30 (0.080) | 11/90 | NT | 8.1% | coding (479/891 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase |
| ? | CP009273 | = 442722 | 396 (1.110) | coding (440/891 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase | |||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/442606‑442683‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgctgcgccgcCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATCT < CP009273/442722‑442657 TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC < 1:12695935/68‑1 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:3551938/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:10866770/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:31576140/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:36127559/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:13463741/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:23202174/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:6716753/1‑65 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:31473409/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:7926638/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:612882/1‑67 GGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGC < 1:1217670/67‑1 GGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT < 1:23728829/65‑1 AAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGC < 1:7466783/67‑1 AAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC < 1:17662153/67‑1 AAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC < 1:35054685/67‑1 AAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC < 1:15586260/67‑1 AAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC < 1:12552700/67‑1 GCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTTCGGTGCGGTAACCGGT > 1:16548040/1‑68 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CGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:28854667/1‑66 CGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:36591218/1‑66 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGCGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:24560240/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCTGCGATCCT > 1:25906909/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:4422383/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:7917502/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:31751246/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:14732609/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:19667196/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:15385307/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:15479679/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:13118504/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:16963544/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:25258154/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:11111619/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:36042393/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:18262232/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGAAAGCGGCGCCGCGCTCCT > 1:3620328/1‑65 gGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGG < 1:10053226/67‑1 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGG < 1:13877614/68‑1 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGG < 1:7077877/68‑1 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:2224098/1‑67 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:8893254/1‑67 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:10349311/1‑67 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:8185537/1‑67 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCTGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:21940463/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:15047605/68‑1 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTACCCGGTGAGTTCGATAGCGGCTCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:34393880/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:37126456/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:399068/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:9410222/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:2980658/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:2787381/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:13008557/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:19704573/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:20756907/1‑68 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCTGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:8572899/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:22762639/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:12093032/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:12346630/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:8703245/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:12978429/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:14436629/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:20530148/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:34858008/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |