| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3538010 | 322 (0.720) | 17 (0.050) | 9/94 | NT | 5.6% | coding (194/771 nt) | bioH | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase |
| ? | CP009273 | = 3538051 | 307 (0.820) | coding (153/771 nt) | bioH | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3537937‑3538010‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggcttcggGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCACC < CP009273/3538051‑3537986 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:9579018/1‑67GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:30700578/1‑67GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:5236731/1‑67GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:17517432/1‑67 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGG < 1:12104400/67‑1 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGG < 1:3858210/67‑1 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGG < 1:20152303/67‑1 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:30244289/1‑66 TTGCCACCCGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGGGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:37008066/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:22749458/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:8907325/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:18682645/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:26572501/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:32264943/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:15331131/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:16256173/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:6256233/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAAACAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:36617248/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCAAACCAAATGGCTTTATAAGGTGCCTGTTGCAGCACGTCT > 1:25958577/1‑68 TGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTT < 1:2847602/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTTCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:8591147/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:10058164/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:11343844/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:29386254/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:23356368/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:23569015/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:9350707/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:36967137/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:10752657/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:26688391/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:26978473/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:15387056/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:33540608/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:16894978/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:5907849/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:5617308/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:6225883/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:4992015/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:2009617/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:12862430/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:19344556/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:32468067/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:12047700/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:30134362/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAAACAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:25278584/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCACCCTAACCCAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:24095500/68‑1 ACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCGTCGGGCGTAGCCGGGGATT > 1:27052674/1‑68 CTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCCCGGCGTCGGGCGGGGCCGGGGGTTT > 1:35594255/1‑68 GCCTAACCAGATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGC > 1:34949510/1‑68 GCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGC > 1:567057/1‑68 GCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGGGCCTGTTGCAGCACGGCGTCGGGCGTCGGCGGGGTTTTGGTGC > 1:3274727/1‑68 CCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCCGGGGGTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGC > 1:3327259/1‑67 CAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCGCGGCTTCGGGGGGAGCCGGGGATTTGGTGCGGTGTC > 1:4871935/1‑67 TCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGGTGTCGCTTGCTGATATG > 1:22525038/1‑68 TCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCCCTTGCTGATATG > 1:5510116/1‑68 TGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGT > 1:33266124/1‑67 AGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGCAGCCGTGCT > 1:16674621/1‑67 GCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGGGCagg > 1:2959699/1‑65 agGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGGAGGGGTGCTGCA > 1:36135464/3‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:20479503/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:33377478/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:20587906/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:23915120/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:25766060/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGGGCagg < 1:29021334/66‑4 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGCGTTTTGGTGCGCTGTGACTTGGTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:23915135/1‑67 CGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAAC < 1:27569261/68‑1 CGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAAC < 1:35298542/68‑1 CGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAAC < 1:30743272/68‑1 GCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGACGCCGTGCTGCAACcg > 1:29878653/1‑66 CTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAG > 1:33973899/1‑67 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGGCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:34182732/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCACCAGG > 1:23349855/1‑67 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:36516957/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:35714671/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:3564086/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:2817558/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:12514010/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:13333658/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:15544182/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:16501167/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:17449429/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:17537733/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:1760673/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:18474813/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:19922318/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:23255516/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:26330747/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:31487644/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:31519499/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:35421387/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGG < 1:16902803/67‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTGGCGGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:7911425/1‑68 TCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCA < 1:9511179/68‑1 TCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCA < 1:324490/68‑1 TCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCA < 1:13568072/68‑1 CGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCAC < 1:10444754/68‑1 GGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCACC < 1:17991533/68‑1 GGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCA > 1:2055143/1‑65 GGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCA > 1:34086220/1‑65 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3537937‑3538010‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggcttcggGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCACC < CP009273/3538051‑3537986 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |