| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 610426 | 182 (0.410) | 21 (0.060) | 5/96 | NT | 9.2% | coding (814/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| ? | CP009273 | = 610453 | 260 (0.680) | coding (841/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent | |||||
Only 100 of 491 total aligned reads displayed.
GATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTT > CP009273/610360‑610493 | gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg > 1:1059135/1‑68 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:18843879/68‑1 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg > 1:24595251/1‑68 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg > 1:25251945/1‑68 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg > 1:16189041/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGa < 1:424559/67‑1 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGa < 1:4098646/67‑1 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:30981608/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCGTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGag > 1:6293681/1‑67 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGTTTTa > 1:28952632/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:36216943/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:1639977/1‑66 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTAt < 1:3829775/66‑1 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTAt < 1:34294422/66‑1 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTAt < 1:10225637/66‑1 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCt > 1:2758246/1‑68 (MQ=255) cAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCg < 1:21261195/67‑1 (MQ=255) cAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCg < 1:19088354/67‑1 (MQ=255) ccTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTg > 1:5270779/1‑68 (MQ=255) ccTTGTGGCTGGGGCGATCGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTg > 1:867574/1‑68 (MQ=255) cTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGAc < 1:21733331/65‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTgg > 1:15743924/1‑67 (MQ=255) ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg > 1:16983331‑M2/1‑66 (MQ=255) ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:23890358‑M2/68‑3 (MQ=255) gCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:26203863‑M2/67‑3 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCCGAGTTATATTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:15058483‑M2/68‑5 (MQ=255) tGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc > 1:26748705‑M2/1‑63 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:34982571‑M2/1‑62 (MQ=255) gggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc < 1:33445963‑M2/68‑8 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:8240665‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:29634909‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:31091776‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:9641243‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:22886301‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:17494655‑M2/1‑60 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:13275493‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:34893283‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGa < 1:7005826/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATCGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCGcggcggcgtagt > 1:9380679‑M2/1‑55 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:20034379‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:12454170‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:33087715‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:25869071‑M2/1‑54 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt < 1:12857884/68‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGc < 1:32924831/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacg > 1:10731308‑M2/1‑49 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacg > 1:2212823‑M2/1‑49 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:21358110/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:11950028/67‑1 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgatt > 1:3232896‑M1/1‑19 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:14584958/1‑68 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:30326607/1‑68 (MQ=255) gTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTgg < 1:12974548/42‑1 (MQ=255) gTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGa < 1:23190019/68‑1 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcaca > 1:27681416‑M1/1‑14 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:24082588/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:16844149/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:19767194/1‑68 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:36366519‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:2857743‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:6803672‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:27006435‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccataagattgcacaa > 1:27748949‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:1860684/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:13925324/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:17994841/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:33867708/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:37016141/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:4742750/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:5708479/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:7662224/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:11106689/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:1491193/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:27270252/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:28061253/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:15599326/67‑1 (MQ=255) cTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataagtggggcggcgtagtccatacgattgcacaatc > 1:34742713‑M1/1‑11 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTg < 1:14519739/67‑1 (MQ=255) cgccgcCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgc > 1:7402548‑M1/1‑8 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccc < 1:18280494‑M1/68‑62 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:24925353‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:16582053‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:13831552‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa > 1:21033594/1‑67 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa > 1:31574695/1‑67 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa > 1:36867404/1‑67 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa > 1:32765086/1‑67 (MQ=255) ccgccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcccc > 1:36835008‑M1/1‑6 (MQ=255) ccgccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcccc > 1:35782835‑M1/1‑6 (MQ=255) ccgccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcccc > 1:33311537‑M1/1‑6 (MQ=255) ccgccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcccc > 1:1760199‑M1/1‑6 (MQ=255) ccgccgagcccagtcgacgcataaagataaatcaggcggggtagtgcatacgattgcacaatcgcccc > 1:34830215‑M1/1‑6 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:25594615/67‑1 (MQ=255) gccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccag < 1:1681346‑M1/68‑65 (MQ=255) gccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccag < 1:17157993‑M1/68‑65 (MQ=255) gccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcccca > 1:2951040‑M1/1‑4 (MQ=255) gccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGt < 1:29938593/68‑1 (MQ=255) cgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccagcc < 1:33397106‑M1/68‑67 (MQ=255) ggATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGtttt < 1:23480564/68‑1 (MQ=255) ggATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGtttt < 1:9001842/68‑1 (MQ=255) | GATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTT > CP009273/610360‑610493 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |