| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3202572 | 297 (0.670) | 22 (0.060) | 6/92 | NT | 9.4% | coding (1190/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
| ? | CP009273 | = 3202615 | 180 (0.490) | coding (1233/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte | |||||
Only 100 of 396 total aligned reads displayed.
TCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCC > CP009273/3202505‑3202638 | gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc > 1:9226990/1‑67 (MQ=255) gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc > 1:22457415/1‑67 (MQ=255) gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc > 1:23833222/1‑67 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:19443492/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:4922173/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:17097083/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:34686540/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:29961878/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACg > 1:7814975/1‑67 (MQ=255) actatggtgatggttGCGTTGATTGCCGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:3569546/65‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGTGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:16595580/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:32196454/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:21901747/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:22175425/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:25307393/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:16497806/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:13130295/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:4690967/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:11756078/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:673964/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTAACTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:10224442/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGGGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:29228775/68‑1 (MQ=255) cGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCg < 1:29561334/68‑1 (MQ=255) gctggtgaaggtgGCGTTGATAGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:13970802/66‑1 (MQ=255) gattgtgatggtGGCGTTGATTGTGGGGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:6465477/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTTCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:1786108/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:16178118/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:32801905/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:13636145/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:19229209/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:9592423/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACAGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:9793958/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGAGTTGATTGTGGGGTTTTATCTACTTCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:21580422/68‑1 (MQ=255) gatggggctggtTGCTTTGATTGGGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:26958288/68‑1 (MQ=255) tggtgatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGta < 1:4260406/67‑1 (MQ=255) ggtggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTcc > 1:24963589/1‑67 (MQ=255) gtggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTcc > 1:31877377/1‑66 (MQ=255) tggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGc > 1:33202755/1‑67 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:12223324/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:28924384/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:34209361/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:37093014/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:18589129/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:11657625/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:2611869/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGc > 1:23705577/1‑66 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTCTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:13313934/67‑1 (MQ=255) gCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGctc > 1:1042548/1‑67 (MQ=255) cGTTGATTGGGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGctct < 1:1600521/67‑1 (MQ=255) tGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCa < 1:10022794/68‑1 (MQ=255) tGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCa < 1:18853086/68‑1 (MQ=255) ttGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCg < 1:20353629/68‑1 (MQ=255) ttGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCg < 1:22839417/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACTGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:15380646/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:1909970/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:21066610/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:4614454/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:29710644/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:10668130/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:17288459/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:3885392/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:28619216/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:18209227/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:1103759/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCGCTCGCACCga < 1:31089312/68‑1 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatga < 1:19657798/68‑1 (MQ=255) tgtTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatgat < 1:28249708/67‑1 (MQ=255) gtTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatgatg < 1:5579999/67‑1 (MQ=255) tttATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGAtt > 1:609917/1‑68 (MQ=255) aTCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct < 1:29362553/68‑1 (MQ=255) aTCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct < 1:27907049/68‑1 (MQ=255) aTCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct < 1:12613787/68‑1 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCTACACCGCGTATACATCAGCTCTCCCACCGATGAAGATtgct > 1:2318106/1‑66 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcagtcatcagcggtgcgagtgcggaggtatacgcggt > 1:35539034‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgt > 1:11328685‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:11897684/1‑66 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:30098739/1‑66 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtg > 1:31271380‑M1/1‑24 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtg > 1:27666694‑M1/1‑24 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:3497697/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACCGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGAAGAAtgctgct > 1:27379006/1‑67 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:24220719‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:8323087‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:7698394‑M2/1‑66 (MQ=255) gcgcTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggc > 1:32404114‑M1/1‑21 (MQ=255) gcgcTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc < 1:30797528‑M2/66‑3 (MQ=255) cgcTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:6969444/39‑1 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaa > 1:26699004‑M1/1‑14 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt > 1:36207207/1‑68 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt < 1:14530011/68‑1 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt < 1:30255085/68‑1 (MQ=255) ttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATg < 1:8139047/68‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGcc < 1:20618217/68‑1 (MQ=255) tCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCg < 1:13835367/68‑1 (MQ=255) cGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagt > 1:28879008‑M1/1‑9 (MQ=255) cGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagt > 1:33991610‑M1/1‑9 (MQ=255) ccAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagta > 1:8650805‑M1/1‑7 (MQ=255) cAGCTCCACGGCGTATACCTCCGCTCACGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagc > 1:26270808‑M2/1‑49 (MQ=255) cAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagc < 1:36740660‑M1/68‑63 (MQ=255) gcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagcgcag > 1:7441699‑M1/1‑2 (MQ=255) | TCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCC > CP009273/3202505‑3202638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |