| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3614228 | NA (NA) | 10 (0.030) | 7/90 | NT | 100% | coding (1677/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3614368 | 0 (0.000) | coding (1817/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
AAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGCAG > CP009273/3614305‑3614435 | aaGACCCGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCCCCGGTGCCCTGACCGCCGTCATctg > 1:32709239‑M2/1‑64 (MQ=255) gCCATGAAACGCGGTATGAATACCACATCGCCGGTGCCCTGACCGCCGTCATctgcccgaagcggt > 1:8940926‑M2/1‑52 (MQ=255) gCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATctgcccgaagcggtca < 1:32170718‑M2/68‑17 (MQ=255) gCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATctgcccgaagcggtca < 1:32850866‑M2/68‑17 (MQ=255) aTGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATctgcccgaagcggtcatgg > 1:29730317‑M2/1‑49 (MQ=255) gcgGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataac < 1:18986245‑M2/68‑27 (MQ=255) tACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacata < 1:8749654‑M2/68‑37 (MQ=255) tgaaccgccGGCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtga > 1:14417010‑M2/4‑14 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:10211175‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:21927990‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:24049564‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:27586786‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:29306146‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:29481826‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:29953847‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:1679922‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:8060792‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:14218643‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:5024844‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:571911‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:13087978‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:1262748‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:34113085‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:21168270‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc < 1:11425303‑M2/67‑57 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:28712677‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:6512640‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:5989540‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:30976701‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:17839590‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:36681855‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:34032046‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:34815103‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagccggtgaagct > 1:27658542‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcgggcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:4390731‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGGCATctgcccgaagcggtcatggtcataacggggtacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:27426324‑M2/1‑11 (MQ=255) ccgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctc > 1:17484264‑M2/1‑10 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:33887091‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:24409010‑M2/1‑9 (MQ=255) gccgTCATtgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc < 1:8348513‑M2/68‑61 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggagcagtcggtgaagctca < 1:20822192‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaccagtcggtgaagctcc < 1:27328120‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:9886962‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:32079181‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:34516943‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:19876369‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:14681484‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:20120760‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:35737489‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:35981432‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:36089213‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:10623325‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:12409011‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:12176246‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:7374008‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtg < 1:24624488‑M2/60‑53 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataaccggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:30418419‑M2/67‑60 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcatcaggggttacatacccggaacagtgggtgaagctcagc > 1:13761929‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca > 1:2631658‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca > 1:31644707‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:1800154‑M2/68‑63 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:30009034‑M2/68‑63 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca > 1:20252627‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca > 1:3880477‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:35219896‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:22772714‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:33010967‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:22207944‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:16454156‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:24941445‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:20512010‑M2/1‑6 (MQ=255) gTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaa > 1:13583724‑M2/1‑5 (MQ=255) cATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:25640095‑M2/65‑63 (MQ=255) cATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:14315232‑M2/65‑63 (MQ=255) cATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:4112326‑M2/65‑63 (MQ=255) cATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:22900558‑M2/65‑63 (MQ=255) cATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:9460061‑M2/65‑63 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttatataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:26998507‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataacgggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:33794842‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataacctgaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:32363478‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:23160911‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:8327716‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:21299386‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:10906713‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:25363695‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:974105‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:4028330‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:27949398‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:29405308‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:34791186‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:19291857‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:16076788‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:26239022‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:10038368‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:7185771‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:11329155‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:15666347‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:15997089‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:18675959‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcgggcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:14563916‑M2/1‑1 (MQ=255) | AAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGCAG > CP009273/3614305‑3614435 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |