| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2436000 = | 304 (0.680) | 20 (0.050) | 8/94 | NT | 7.4% | coding (758/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme |
| ? | CP009273 | 2436103 = | 244 (0.650) | coding (861/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme | |||||
Only 100 of 372 total aligned reads displayed.
GGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGG > CP009273/2436036‑2436169 | gggAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGc < 1:9209301/68‑1 (MQ=255) caataccaccgccgataatcgccgcgtcccgtttgcggctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggc < 1:2902252‑M2/1‑1 (MQ=255) ataccaccgccgataatcgccgcttcccgtttgctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTgg < 1:18205778‑M2/4‑1 (MQ=255) cggcgATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAg > 1:9570295/1‑68 (MQ=255) gccgataatcgccgcttcccgtttgctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAAc < 1:35665712‑M2/12‑1 (MQ=255) gccgataagcgccgcttcccgtttgctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAAc < 1:8361126‑M2/12‑1 (MQ=255) ttATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAAc < 1:116272/67‑1 (MQ=255) ttATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAAc < 1:36223533/67‑1 (MQ=255) tATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGc < 1:36678289/68‑1 (MQ=255) tATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGc < 1:16803999/68‑1 (MQ=255) tATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGc < 1:32341981/68‑1 (MQ=255) tATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGc < 1:27865597/68‑1 (MQ=255) cgataatcgccgcttcccgtttgctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAACGc < 1:15334678‑M2/14‑1 (MQ=255) cgataatcgccgcttcccgtttgctgctgcccgggcggttaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAACGc < 1:25663433‑M2/14‑1 (MQ=255) aTCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCt > 1:803032/1‑68 (MQ=255) gcggTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTAt > 1:15669179/1‑68 (MQ=255) gcggTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTAt > 1:4353604/1‑68 (MQ=255) gcggTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTAt > 1:18683204/1‑68 (MQ=255) tggtATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTgc < 1:24158610/67‑1 (MQ=255) tATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGcgcg < 1:10074269/67‑1 (MQ=255) tATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGcgcg < 1:25032978/67‑1 (MQ=255) tATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCgg > 1:6239584/1‑68 (MQ=255) cccccgtctgctgcggcccgcgcggtaaacccacggcgcggCGGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:28364107‑M2/27‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:33486047/68‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:27245128/68‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:36511666/68‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:26472295/68‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:9814330/68‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:11130072/68‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGGCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:1960306/68‑1 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:14176345/1‑68 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:3174971/1‑68 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:12815815/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:20163800/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:13668781/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:34523045/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:3774199/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:13122628/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:5312435/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:17719297/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:17980258/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:20659525/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCCCGGATGAg > 1:19818773/1‑68 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCATGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:5200696/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcccc < 1:35428066/68‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGccc > 1:30034356/1‑67 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:35046455/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:26312631/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:21265023/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:30921200/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:22768712/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:4985459/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:29439650/66‑1 (MQ=255) gcgTTGGTGGCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:28219522/66‑1 (MQ=255) ctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGccccc > 1:19139026‑M2/32‑68 (MQ=255) cgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGccccc > 1:30698601/1‑68 (MQ=255) gttgttGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCg < 1:24522128/68‑1 (MQ=255) gttgttGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCCTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCg < 1:28739778/68‑1 (MQ=255) ttgttgTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACTCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCg < 1:5675542/67‑1 (MQ=255) tgttgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGc < 1:4721059/67‑1 (MQ=255) tgttgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGc < 1:31972782/67‑1 (MQ=255) tgttgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGc < 1:3961141/67‑1 (MQ=255) tgttgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCa < 1:19423588/68‑1 (MQ=255) tggtgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGc < 1:2379839/64‑1 (MQ=255) tgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGc > 1:29653913‑M2/28‑66 (MQ=255) tgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTg > 1:7081499/1‑68 (MQ=255) gtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTgg < 1:10600405/68‑1 (MQ=255) cGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:16703607/1‑68 (MQ=255) cGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:782416/1‑68 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGCGGCCCCCGCACTGGGt > 1:33188990/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:4137081/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:6616137/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:8771841/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:12549689/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:742625/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:2027628/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:14699217/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:24802741/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:1762515/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGG‑CCCCGCACTGGGTGCt > 1:21162775/1‑68 (MQ=255) cTGGCCCTATTACGGCGCCGCTGGCTGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACggggg > 1:35919486/1‑65 (MQ=255) gggCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGc < 1:22160160/66‑1 (MQ=255) aTTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGTATTATGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGc < 1:31405744/67‑1 (MQ=255) acggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATc < 1:16237911‑M2/59‑1 (MQ=255) acggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATc > 1:32565106‑M2/10‑68 (MQ=255) cggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg < 1:10325660‑M2/60‑1 (MQ=255) cggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg < 1:1723049‑M2/60‑1 (MQ=255) ggggcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg > 1:36064389‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg > 1:27962009‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg > 1:27035170‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg > 1:33812544‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg > 1:21905675‑M2/8‑67 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:29786948‑M2/6‑68 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:26764239‑M2/6‑68 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:2518208‑M2/6‑68 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:30490328‑M2/6‑68 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:12227470‑M2/6‑68 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:21633220‑M2/6‑68 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:14001185‑M2/6‑68 (MQ=255) ggCAGGCAGGTAACGCTATATTGCGCGGACCAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAggg < 1:23063826‑M2/66‑1 (MQ=255) | GGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGG > CP009273/2436036‑2436169 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |