Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ CP009273 2597319 2598085 767 177 [116] [145] 159 hyfC hydrogenase 4, membrane subunit

Only 100 of 159 total aligned reads displayed.

AGAAAACACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTAA  >  CP009273/2598048‑2598153
                                      |                                                                   
acaaaaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtg                                        <  1:13612000/66‑1 (MQ=255)
  aaaaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCtt                                         >  1:16357437/1‑65 (MQ=255)
  aaaaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgct                                      <  1:29866275/68‑1 (MQ=255)
   aaaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgct                                      >  1:18253729/1‑67 (MQ=255)
    aaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                                    <  1:10016525/68‑1 (MQ=255)
    aaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                                    <  1:34465823/68‑1 (MQ=255)
    aaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                                    <  1:32370908/68‑1 (MQ=255)
    aaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                                    <  1:36877012/68‑1 (MQ=255)
    aaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                                    <  1:20637573/68‑1 (MQ=255)
    aaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                                    <  1:18291263/68‑1 (MQ=255)
     acacGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                                    >  1:16704387/1‑67 (MQ=255)
     acacGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                                    >  1:1280057/1‑67 (MQ=255)
     acacGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                                    >  1:3108639/1‑67 (MQ=255)
     acacGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                                    >  1:23205869/1‑67 (MQ=255)
     acacGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTgcg                                   <  1:17909778/68‑1 (MQ=255)
     acacGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGCCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                                    >  1:34211995/1‑67 (MQ=255)
       acGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCt                                 >  1:9393547/1‑68 (MQ=255)
       acGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCt                                 >  1:11589884/1‑68 (MQ=255)
       acGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCt                                 >  1:30462276/1‑68 (MQ=255)
         gCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTg                               <  1:8775197/68‑1 (MQ=255)
         gCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTg                               <  1:10197594/68‑1 (MQ=255)
             gCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCAt                            >  1:25940672/1‑67 (MQ=255)
               aCGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATggg                         >  1:20687143/1‑68 (MQ=255)
               aCGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATggg                         <  1:14715508/68‑1 (MQ=255)
               aCGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATggg                         >  1:4504706/1‑68 (MQ=255)
               aCGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATggg                         >  1:25883769/1‑68 (MQ=255)
                cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                        <  1:24015181/68‑1 (MQ=255)
                cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                        <  1:12348584/68‑1 (MQ=255)
                cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                        <  1:22209304/68‑1 (MQ=255)
                cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                        <  1:4548811/68‑1 (MQ=255)
                cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                        <  1:17642415/68‑1 (MQ=255)
                cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                        <  1:6576928/68‑1 (MQ=255)
                cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                        <  1:14530216/68‑1 (MQ=255)
                 gcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtc                       <  1:2683052/68‑1 (MQ=255)
                 gcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtc                       <  1:11207261/68‑1 (MQ=255)
                 gcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtc                       <  1:397946/68‑1 (MQ=255)
                 gcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtc                       <  1:20258550/68‑1 (MQ=255)
                      cGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtcttct                   <  1:18005948/67‑1 (MQ=255)
                      cGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtcttct                   <  1:14985678/67‑1 (MQ=255)
                      cGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtcttct                   <  1:35989012/67‑1 (MQ=255)
                      cGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtcttct                   <  1:13938681/67‑1 (MQ=255)
                      cGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtcttct                   <  1:13289389/67‑1 (MQ=255)
                       gTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTgg                 <  1:27111552/68‑1 (MQ=255)
                       gTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTgg                 <  1:31577934/68‑1 (MQ=255)
                       gTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTg                  <  1:32205185/67‑1 (MQ=255)
                         tttttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTg                               <  1:14048031/52‑1 (MQ=255)
                         tttttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGt                <  1:12101381/67‑1 (MQ=255)
                         tttttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGt                <  1:4927803/67‑1 (MQ=255)
                         tttttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGt                <  1:29153712/67‑1 (MQ=255)
                           tttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTa              >  1:19521071/1‑67 (MQ=255)
                           tttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTa              >  1:15417684/1‑67 (MQ=255)
                             tACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAAcc           >  1:23561044/1‑68 (MQ=255)
                             tACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAAcc           >  1:16925747/1‑68 (MQ=255)
                              aCTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCg          >  1:35167208/1‑68 (MQ=255)
                              aCTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCg          >  1:35963276/1‑68 (MQ=255)
                               cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg         >  1:28403733/1‑68 (MQ=255)
                               cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg         >  1:165994/1‑68 (MQ=255)
                               cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg         <  1:17223956/68‑1 (MQ=255)
                               cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg         <  1:29225143/68‑1 (MQ=255)
                               cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg         <  1:6205988/68‑1 (MQ=255)
                               cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg         <  1:25040149/68‑1 (MQ=255)
                               cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg         <  1:11994474/68‑1 (MQ=255)
                               cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg         <  1:30650070/68‑1 (MQ=255)
                               cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCCGGTTAACCgg         <  1:36635569/68‑1 (MQ=255)
                               cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGATCTTCTGGTTAACCgg         <  1:17347047/68‑1 (MQ=255)
                                tCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg         >  1:27615507/1‑67 (MQ=255)
                                 cATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTc       <  1:4818033/68‑1 (MQ=255)
                                 cATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTc       <  1:32710970/68‑1 (MQ=255)
                                 cATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTc       <  1:31703451/68‑1 (MQ=255)
                                 cATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTc       <  1:31494992/68‑1 (MQ=255)
                                 cATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTc       <  1:31439215/68‑1 (MQ=255)
                                 cATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTc       <  1:22387724/68‑1 (MQ=255)
                                 cATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTc       <  1:10542190/68‑1 (MQ=255)
                                 cATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTc       <  1:18239134/68‑1 (MQ=255)
                                 cATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTc       <  1:6092534/68‑1 (MQ=255)
                                 cATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTc       <  1:12972500/68‑1 (MQ=255)
                                  aTTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCt      <  1:10064866/68‑1 (MQ=255)
                                    tCACCGTGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGt    <  1:28550552/68‑1 (MQ=255)
                                    tCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGt    <  1:8804437/68‑1 (MQ=255)
                                    tCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGt    <  1:3887836/68‑1 (MQ=255)
                                    tCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGt    <  1:25340413/68‑1 (MQ=255)
                                    tCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGt    <  1:7349830/68‑1 (MQ=255)
                                    tCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGt    <  1:30689982/68‑1 (MQ=255)
                                    tCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGt    <  1:6621350/68‑1 (MQ=255)
                                    tCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGt    <  1:11637085/68‑1 (MQ=255)
                                     cACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTa   >  1:28667068/1‑68 (MQ=255)
                                     cACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTa   >  1:24957280/1‑68 (MQ=255)
                                     cACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTa   >  1:7024291/1‑68 (MQ=255)
                                     cACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTa   >  1:13149179/1‑68 (MQ=255)
                                      aCCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGtta  <  1:7389381/68‑3 (MQ=255)
                                      aCCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTaa  >  1:5003388/1‑68 (MQ=255)
                                      aCCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTaa  >  1:10233805/1‑68 (MQ=255)
                                      aCCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTaa  >  1:10352617/1‑68 (MQ=255)
                                      aCCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTaa  >  1:14467192/1‑68 (MQ=255)
                                      aCCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTaa  >  1:5821888/1‑68 (MQ=255)
                                      aCCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTaa  >  1:22818142/1‑68 (MQ=255)
                                      aCCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTaa  >  1:22850147/1‑68 (MQ=255)
                                      aCCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTaa  >  1:29318841/1‑68 (MQ=255)
                                      aCCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTaa  >  1:30182902/1‑68 (MQ=255)
                                      aCCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTCAACCGGTCTGTaa  >  1:19439522/1‑68 (MQ=255)
                                      |                                                                   
AGAAAACACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTAA  >  CP009273/2598048‑2598153

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑