Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 151,734 | 0 | A | C | 28.9% | 136.1 / 20.6 | 76 | V166V (GTT→GTG) | yadL | putative fimbrial protein YadL |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/16); new base C (0/22); total (38/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.12e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
TTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATT > NC_000913/151585‑151883 | ttGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGAtaataa > 1:1913444/1‑150 (MQ=255) gAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAAc < 1:5029/150‑1 (MQ=255) gATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGc > 1:1026026/1‑150 (MQ=255) gATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGc > 1:1514824/1‑150 (MQ=255) atataGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCt > 2:632048/1‑150 (MQ=255) gTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGt > 2:1826272/1‑150 (MQ=255) ccTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGga > 1:1334187/1‑150 (MQ=255) cTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGgag > 2:2013718/1‑150 (MQ=255) tGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGgaga > 1:1641461/1‑150 (MQ=255) aaTCTGTAATTCTGTTATTTATCGGTTAGTGTAAATGTGGCTGGTGAAGAAAACTTCCCCGCAGTGAAATTGTTTAGGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCCGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGAtt < 2:1683782/150‑1 (MQ=255) tGTAAGTCTGTTTGTTATAGGTTACTTTAAATGTGGATGGTCCAAAAAACTTCCCCGCAGTTACATTTTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACACAGCGTAAAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTa < 2:1701577/150‑1 (MQ=255) ttatgTCTGTTTTTTATAGTTTACTTTAAATGTGGCGGGTGCATAAAACTTCCCCCCTGTGACTTTGTTTACGTTTTTATTTTTTT‑CCCCCACCCGGCGTGCACTCAGCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTAc < 2:666807/146‑1 (MQ=255) gTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTAc > 1:1884426/1‑150 (MQ=255) gTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACctct > 2:1232293/1‑150 (MQ=255) tCTGTTTGTTATCGTTTACTTTAAATGTGGCTGGTGAATAAAACTTCCCCCCAGTTACTTTTTTTAGGGTTTTTTTTTTTA‑CCCCCCCCTGGCGTCCACTCCTCGTATAAAACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCtt < 1:50462/150‑1 (MQ=255) tCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCtt > 1:525809/1‑150 (MQ=255) tCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCtt > 2:2119739/1‑150 (MQ=255) tgtttgttATTGGTTACTTTAATTGTGGGTGGTGCATAAAACTTCCCCGCAGTGACTTTGTTTACGTTTTTATTTTTTC‑CCCCGACCCGGCGTGCACTCATCGTATAATACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTtgt < 1:1755525/150‑1 (MQ=255) tagttaTCGGTTACTTTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCTGTGAAATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGAt < 2:1001980/150‑1 (MQ=255) tagttaTAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGAt > 1:293744/1‑150 (MQ=255) ttttaTAGGTTACTTTAATTGTGGCTGGTGCATAAAACTTACCCGCTGTCACTTTGTTTAGGTTTTTTTTTTTTT‑CCACGACCCGGCGTGCACTCATGGTATAATACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATg < 1:1866960/148‑1 (MQ=255) gttaTAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGc > 1:81874/1‑150 (MQ=255) tataGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAAATTACCCGCTGTTACATTGTTTACGTTTTTATTTTTTT‑CCACGACCCGGCGTGCACTCATCGGATAATACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTg < 2:1641461/150‑1 (MQ=255) 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tgaaattgtgTCTGTTGAATAAAATTTACCGCCAGTTATTTTTTTTAGGTTTTTTTTTTTTA‑CCACGCCCAGGCTTTCACTCTTGGTTTAAAACACGACAGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTAcaca < 1:812220/144‑1 (MQ=255) tGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTAcaca > 1:88617/1‑150 (MQ=255) tGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTAcaca > 2:893119/1‑150 (MQ=255) tAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGc > 1:2062454/1‑150 (MQ=255) aaTGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTa > 2:696840/1‑150 (MQ=255) 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gtgaataaaaCTAACCCGCTGTGAAATTTTTTAGGTTTTTATTTTTTA‑CCCCGCCCCGGGGTGCACTCATCGTATAAAACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTg < 1:750839/144‑1 (MQ=255) gTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTg < 2:1992575/150‑1 (MQ=255) gaataaaaATTACCCGCAGTGAATTTTTTTAGGTTTTTTTTTTTTA‑CCACCACCAGGCGTGCACTCATGGTATAAAACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCa < 1:649829/146‑1 (MQ=255) caaaaaaaCTTACCCGCTGTGACATTGTTTAGGTTTTTATTTTTTT‑CCCCCACCCGGCGTGCACACATCGTATAAAACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCa < 1:785712/146‑1 (MQ=255) cAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCAc > 1:2027778/1‑150 (MQ=255) cAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCAc > 1:834594/1‑150 (MQ=255) aaaCTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTccc > 1:490991/1‑150 (MQ=255) cTTACCCGCTGTGAATTTTTTTACGTTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGTATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGt < 2:909310/150‑1 (MQ=255) tACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGTATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTg < 2:1642229/150‑1 (MQ=255) ccGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTACACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCg > 2:231793/1‑150 (MQ=255) 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tttttttACGGTTTTATTTTTTT‑CCCCGCCCAGGCGTGCACTCATGGGATAATACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGt < 1:1403851/146‑1 (MQ=255) aTTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGt > 2:408943/1‑150 (MQ=255) aTTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGt > 2:1733118/1‑150 (MQ=255) ttGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTg > 1:1046317/1‑150 (MQ=255) ggTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGAc > 2:1795930/1‑150 (MQ=255) ttATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCa > 1:756160/1‑150 (MQ=255) tATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCaa > 2:1791859/1‑150 (MQ=255) cttttttt‑CCACGACCCGGCGTGCACTCAGCGGATAATCAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTGACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAAc < 2:1833171/149‑1 (MQ=255) aTTTTTTG‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGTTAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAAc < 2:1833497/150‑1 (MQ=255) t‑CCACCACCAGGGGTGCAAACTTGGTATAATACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACa < 1:632048/150‑1 (MQ=255) ccACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAg < 1:2017929/150‑1 (MQ=255) aCGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCa > 1:1066461/1‑150 (MQ=255) cGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCAc > 2:328218/1‑150 (MQ=255) gCGTCCACACATCGTATAATACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCttt < 1:708432/150‑1 (MQ=255) gTGCACTCATCGGATAATACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTAt < 1:967892/150‑1 (MQ=255) gTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTAt < 2:525809/150‑1 (MQ=255) gTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACATCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCACTGTTGCCGGAGTTACAGTGATCCAGACTTCAACGGCGACAGCAATTGCTTTAt > 1:856289/1‑150 (MQ=255) aCTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGc > 2:424491/1‑150 (MQ=255) aCTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGc > 1:1180126/1‑150 (MQ=255) aTCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCt > 2:888507/1‑150 (MQ=255) aTCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCt > 1:1090017/1‑150 (MQ=255) cGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTGTCTGCGGCtgt < 2:949835/150‑1 (MQ=255) ggATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCtgtg > 1:410564/1‑150 (MQ=255) gATAATACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTgg < 1:472258/150‑1 (MQ=255) aaCGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCAtt < 1:328218/150‑1 (MQ=255) aaCGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCAtt > 1:51272/1‑150 (MQ=255) | TTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTT‑CCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATT > NC_000913/151585‑151883 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |