New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3885280 | 456 (2.440) | 10 (0.060) | 8/288 | 4.3 | 2.3% | coding (205/1647 nt) | yidC | membrane protein insertase YidC |
? | NC_000913 | = 3885315 | 416 (2.300) | coding (240/1647 nt) | yidC | membrane protein insertase YidC | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATGATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3885127‑3885280 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcttg‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCTGAG < NC_000913/3885315‑3885167 cTGATCTGGTAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACACCGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTG < 2:2927690/149‑1 ATGATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGCTCTCGGTTAAGACCGACGTG > 1:2265101/1‑150 ATGATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTG > 1:2265174/1‑150 ATGATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTG > 2:1235454/1‑150 TGATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGC < 1:1387486/150‑1 TGATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGC > 1:2132876/1‑150 TGATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGC > 1:2179402/1‑150 TGATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGC < 1:378776/150‑1 TGATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGC < 1:609060/150‑1 TGATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCACAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGC < 2:2166937/150‑1 GATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCT > 1:1335223/1‑150 ATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTT > 1:214275/1‑150 ATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTT > 2:1302295/1‑150 ATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTT > 1:1527551/1‑150 ATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTT > 1:4500/1‑150 TCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTG > 1:2318196/1‑150 TCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTG > 2:1324765/1‑150 TCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTG > 2:1840028/1‑150 TCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTG > 1:2318027/1‑150 CCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTGATCTGACCATCACCACCACGGGTGTTGAT < 2:884243/150‑1 CCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTGATCTGACCATCACCACCACGGGTGTTGAT < 2:884172/150‑1 CGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTGATCTGACCATCACCACCACGGGTGTTGATG < 2:758709/150‑1 ACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTGATCTGACCATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCA < 2:1164795/150‑1 GGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGC < 2:2108032/150‑1 CCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCAC < 2:1665201/150‑1 CCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACG < 1:966977/150‑1 CCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACG < 1:966991/150‑1 CAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGT < 1:1519528/150‑1 AACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTC < 2:430515/150‑1 CTTG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCT > 2:780277/1‑150 CTTG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCT > 2:413667/1‑150 CTTG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCT > 1:2775070/1‑150 CTTG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCT > 2:2716413/1‑150 CTTG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCT > 2:413574/1‑150 TTG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCTG < 2:1533/150‑1 TTG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCTG < 1:633310/150‑1 TG‑‑CTCAACATCACCACCCCGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCTGA < 2:1246201/150‑1 TG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCTGA < 1:1409245/150‑1 TG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCTGA < 2:1859587/150‑1 TG‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCTGA < 2:1246190/150‑1 G‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCTGAG < 1:210464/150‑1 G‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCTGAG > 2:2108625/1‑150 G‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCTGAG > 2:1712630/1‑150 G‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCTGAG < 2:1468627/150‑1 G‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCTGAG < 2:1468626/150‑1 ATGATCTGGCAAGCCTGGGAGCAGGATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3885127‑3885280 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcttg‑‑CTCAACATCACCACCACGGGTGTTGATGGTCAGATCAAGCACGTCGGTCTTAACCGAGATCAGTTTCCCCTGGCCACTGGCCGGTACGCCCTGGTCGGCGGCGCTACCCGCTGCGGTGGTCGTTGTCTGCGTGGTCTGTTGGGCCTGAG < NC_000913/3885315‑3885167 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |