Read alignment evidence... | |||||||||||
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.56e-16 | |||||||||||
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Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
TTCATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTG‑ACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCGTTATCG > NC_000913/361171‑361469 | ttCATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAAc < 2:969949/150‑1 (MQ=255) ttCATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAAc < 2:1335273/150‑1 (MQ=255) ccGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACa < 1:254802/150‑1 (MQ=255) 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gcgAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTG‑ACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAAt > 1:1444362/1‑150 (MQ=255) cgAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTG‑ACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATc < 2:946969/150‑1 (MQ=255) gAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTG‑ACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCg > 1:43455/1‑150 (MQ=255) gAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTG‑ACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCg < 2:1176168/150‑1 (MQ=255) aTAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTG‑ACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCGtt < 1:877022/150‑1 (MQ=255) aTAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTG‑ACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCGtt > 2:1289232/1‑150 (MQ=255) tAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTG‑ACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCGTTa > 2:46031/1‑150 (MQ=255) aCCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTG‑ACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCGTTATc < 2:1247040/150‑1 (MQ=255) cccGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTG‑ACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCGTTATCg > 1:761518/1‑150 (MQ=255) cccGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTG‑ACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCGTTATCg > 1:757421/1‑150 (MQ=255) cccGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTG‑ACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCGTTATCg < 2:2487695/150‑1 (MQ=255) | TTCATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTG‑ACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCGTTATCG > NC_000913/361171‑361469 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |