| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3790299 | 221 (1.300) | 14 (0.090) | 12/280 | 2.7 | 6.1% | intergenic (‑218/+21) | waaH/tdh | UDP‑glucuronate:LPS(HepIII) glycosyltransferase/threonine dehydrogenase |
| ? | NC_000913 | = 3790303 | 221 (1.390) | intergenic (‑222/+17) | waaH/tdh | UDP‑glucuronate:LPS(HepIII) glycosyltransferase/threonine dehydrogenase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTAAGCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3790142‑3790299‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagggctggTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATAATAT < NC_000913/3790303‑3790155 TTAAGCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAA > 1:2105339/1‑150 TAAGCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAA > 2:983883/1‑150 TAAGCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAA < 2:861641/150‑1 AGCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGG < 2:2125762/150‑1 AGCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGG < 1:1046452/150‑1 AGCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGG > 1:630446/1‑150 AGCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGG > 1:1884537/1‑150 GCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGG < 2:2263456/150‑1 GCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGG > 2:2014648/1‑150 GCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGG < 2:1857817/150‑1 GCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGG > 1:1815364/1‑150 GCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGG > 1:341704/1‑150 CTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCT > 1:960522/1‑150 CTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCT > 1:68674/1‑150 TGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTG < 1:1134392/150‑1 TGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTG < 1:1902114/150‑1 TGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTG < 1:546884/150‑1 GTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGG < 2:45483/150‑1 GTGAGATATTATTCTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGG < 2:2705962/150‑1 ATTTTTACAGGTGAGAGAGTCTCTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGATATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCC < 1:1721490/150‑1 TTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCCC < 2:2664542/150‑1 TTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCCC < 2:2664860/150‑1 TTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCCCT < 2:967348/150‑1 TTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCCCTT < 1:180957/150‑1 TACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCCCTTTT < 1:1123201/150‑1 TACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCCCTTTT > 1:2553350/1‑150 ACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCCCTTTTA < 1:1336436/150‑1 TGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGA < 2:2105339/150‑1 GAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAG < 2:342304/150‑1 TATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAA < 2:226843/150‑1 TATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACCGACAGGATTTTACCTATTTAACAGATTAACCACAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAA < 2:227786/150‑1 TAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGA < 1:1109614/150‑1 GAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTT < 2:2553350/150‑1 AAGGGCTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAA < 1:2147073/150‑1 GGGCTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAA > 2:1408943/1‑150 GGGCTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAA < 1:1536442/150‑1 GCTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATA > 1:1142502/1‑150 GCTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATA > 2:2447624/1‑150 GCTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATA > 1:531999/1‑150 CTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATAA < 2:496170/150‑1 CTGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATAA > 1:2273814/1‑150 TGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATAAT > 1:1427088/1‑150 TGGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATAAT < 2:1464145/150‑1 GGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATAATA > 2:1236406/1‑150 GGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATAATA < 1:456603/150‑1 GGTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATAATA < 1:456352/150‑1 GTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATAATAT < 2:1966221/150‑1 GTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATAATAT > 2:2607733/1‑150 TTAAGCCTGTGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3790142‑3790299‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagggctggTATTCCAGCCCTTTTATCTGAGGATAATCTGTTAAATATGTAAAATCCTGTCAGTGTAATAAAGAGTTCGTAATTGTGCTGATCTCTTATATAGCTGCTCTCATTATCTCTCTACCCTGAAGTGACTCTCTCACCTGTAAAAATAATAT < NC_000913/3790303‑3790155 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |