| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
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1:1177881/1‑149 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 1:1177869/1‑149 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 2:2508849/1‑149 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 1:1836757/1‑149 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 2:2297400/1‑149 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA < 2:2227712/149‑1 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 1:2591271/1‑149 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 1:454285/1‑149 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 2:1196032/1‑149 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA < 2:1414538/149‑1 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 2:1510004/1‑149 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 2:1504815/1‑149 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTCCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 1:1424042/1‑149 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGGTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 2:2247247/1‑149 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGGTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 2:16977/1‑149 TACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAtcacca‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3620203‑3620350‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCACCACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA < NC_000913/3620425‑3620272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |