Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 361,311 | 0 | C | A | 27.6% | 506.7 / 28.7 | 239 | E184* (GAA→TAA) | lacA | galactoside O‑acetyltransferase |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.11e-25 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
CGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCC > NC_000913/361164‑361458 | cgcTTTGTTCATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTcg < 1:1860199/149‑1 (MQ=255) gcTTTGTTCATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTcgc < 2:2927251/149‑1 (MQ=255) tttGTTCATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTTTTTAGCGa > 1:839002/1‑149 (MQ=255) 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aGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGa < 2:1847541/149‑1 (MQ=255) gCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACtt < 2:1125562/149‑1 (MQ=255) cTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTc < 2:1877843/149‑1 (MQ=255) cTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTc < 1:2801102/149‑1 (MQ=255) aTCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGa < 1:2156036/149‑1 (MQ=255) gTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGa > 2:3113487/1‑149 (MQ=255) gTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGa < 2:348000/149‑1 (MQ=255) tCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGAc < 1:2633773/149‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTa < 2:58220/149‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTa > 2:2214654/1‑149 (MQ=255) tATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTAt < 2:1890707/149‑1 (MQ=255) tCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGcc > 2:1349166/1‑149 (MQ=255) | CGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCA‑GCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCC > NC_000913/361164‑361458 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |