Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 843,196 | 0 | T | G | 25.0% | 227.6 / 14.7 | 117 | F289V (TTT→GTT) | rlmF | 23S rRNA m(6)A1618 methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/57); new base G (29/0); total (59/58) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.07e-11 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |