| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5164773 | 71 (1.450) | 9 (0.240) | 9/194 | 3.3 | 13.9% | intergenic (+39/+67) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 5164788 | 58 (1.560) | intergenic (+54/+52) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCT > NC_002947/5164624‑5164922 | gACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGATGGAGAAGCAAGGGCTGTATGCCCGTTAGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTaca < 1:669003/150‑1 (MQ=255) aaGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAg < 1:781501/150‑1 (MQ=255) ggggCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGt > 2:918279/1‑150 (MQ=255) ttGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATc > 2:208859/1‑150 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGt < 1:918279/150‑1 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGt < 1:898023/150‑1 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGt < 1:208859/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAg > 2:951709/1‑150 (MQ=255) tgCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACGTGCGCGGCGTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGc < 1:182470/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCACACTGAGTTTCTGTAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACAACGAGAGCGGAGGTTTTGTCGGGGTAGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGc < 1:416724/150‑1 (MQ=255) gCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCAGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGt > 1:728398/1‑150 (MQ=255) acaGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTa > 2:60641/1‑150 (MQ=255) acaGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTCGTGGCACCACCAGACCGGAGGTATTGTCGGGGTCGATTGACGCCTGCGCGGCCTGTTCGCGCGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑CGTAGGCGCGGGGTTa > 1:871184/1‑150 (MQ=255) gCTGGAGCGTCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCTCCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGTTACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGTTCCTACA‑ACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaaaa < 1:174027/150‑1 (MQ=17) gCTGGAGCAGCAGGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCAACACCAGATCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACATGCGCGTCCTTTTAACGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGATCGCTATCGT‑TGTAGGCGCGTGTTTACCCGCGaaaa < 2:289544/150‑1 (MQ=38) ggAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGc < 1:60641/150‑1 (MQ=255) gAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGcc > 2:1185657/1‑150 (MQ=255) gcaAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAAGAGCGGGTTTACCCCCGAAAAGGCCAGcac > 2:585406/1‑150 (MQ=255) gcaAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTACGCGGCCTGTTCGCGGGTAAACCCCCTCCAACACACGTTAGCTATCAT‑TCTAGGAGCGGGTTGACCCGCGAAAAGGACGGcac > 1:981564/1‑150 (MQ=255) aGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACACGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGcacacg > 2:90704/1‑148 (MQ=255) gggCTGTCTGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTGTCGCGGGTAAACGCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGTCCGGcagaagc > 1:612853/1‑145 (MQ=39) gatGTATGTCCGGTTGTGGTATCCTCAGACCGTAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCaa < 1:377180/148‑1 (MQ=37) ccGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAac > 1:1187919/1‑142 (MQ=255) ccGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAac < 2:1187919/142‑1 (MQ=255) gggTTGTGGCACCACGAGAGCGGAGGTTCCGTAGGATCCGTTTCAACCCGTTTCGGGCTTTTCGCGGGTCAATCCGGGGCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctc < 1:287778/149‑1 (MQ=16) ggTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctct < 1:1182622/150‑1 (MQ=255) ttGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCa < 1:951709/150‑1 (MQ=255) gCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGGGGGTAAACCCGCGCCTACACAGGTTGGCTATCGG‑TGTTGGAGCGGGTATACCCGCGAAAAGGCCGGAACAGGCACCACAGATGTATAAGTccc > 2:896846/1‑150 (MQ=255) gCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctc > 2:828804/1‑142 (MQ=255) gCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctc < 1:828804/142‑1 (MQ=255) accaccAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcgg > 2:583806/1‑150 (MQ=255) accaccAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcgg > 1:422316/1‑150 (MQ=255) accaGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAaca < 2:1172399/129‑1 (MQ=255) accaGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAaca > 1:1172399/1‑129 (MQ=255) aGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCcgc > 2:715054/1‑104 (MQ=255) aGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:715054/104‑1 (MQ=255) aCCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAggg < 1:120850/150‑1 (MQ=255) cGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAggg > 1:1052060/1‑148 (MQ=255) cGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAggg < 2:1052060/148‑1 (MQ=255) cGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCa > 2:1061475/1‑150 (MQ=255) ggAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAgg < 1:103740/116‑1 (MQ=255) ggAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAgg > 2:103740/1‑116 (MQ=255) ggggTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCgcgc > 2:83062/1‑150 (MQ=255) gATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGCGTAAACCAGCGCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGACACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCTGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTc > 2:157932/1‑150 (MQ=39) gACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCa < 1:1138281/150‑1 (MQ=255) acacCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCAt > 2:853738/1‑150 (MQ=255) acCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATAc > 2:1032739/1‑150 (MQ=255) acCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATAc < 1:83062/150‑1 (MQ=255) cTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATAccc > 1:1226934/1‑150 (MQ=255) tGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATAcccc < 2:422316/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCtt < 1:583806/150‑1 (MQ=255) gcgGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTg > 1:878060/1‑150 (MQ=255) ccTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAtgg < 2:453965/112‑1 (MQ=255) ccTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAtgg > 1:453965/1‑112 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCTACACAGATCTCTCAGTCAAGGCCATCCACGATCAACCCCCTCGTCTGTTCTGCATACCCCTTGACCCCt > 1:931780/1‑150 (MQ=21) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAAc > 1:55073/1‑114 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAAc < 2:55073/114‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc < 1:148131/150‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGtt > 1:876651/1‑150 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCcgcac > 2:486587/1‑113 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCcgcac < 1:486587/115‑3 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCt < 1:1032739/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctc < 1:899789/79‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctc > 2:899789/1‑79 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgca < 1:853738/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTcc < 2:146792/85‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTcc > 1:146792/1‑85 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcagc > 1:873484/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGAATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcagc > 2:620424/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcagca < 2:878060/150‑1 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTc < 2:352257/110‑1 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTc > 1:352257/1‑110 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAtcct > 2:802327/1‑150 (MQ=255) | GACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCT > NC_002947/5164624‑5164922 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |