| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1015841 = | 23 (0.060) | 410 (1.060) | 160/290 | 0.4 | 94.7% | intergenic (‑68/‑700) | SBRG_Ecoli_galE/prfC | SBRG_Ecoli_galE/peptide chain release factor 3 |
| ? | NC_002947 | 4541196 = | NA (NA) | intergenic (+730/‑85) | PP_4022/PP_4024 | hypothetical protein/transposase | |||||
Only 100 of 410 total aligned reads displayed.
CGGCCAACGGTTCGACGCATGCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1015989‑1015841‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTTTCGAA > NC_002947/4541196‑4541344 CGGCCAACGGTTCGACGCATGCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCG > 1:3145243/1‑150 AACGGTTCGACGCATGCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGG < 2:7830081/150‑1 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2:3531951/1‑150 GCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATACAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATT < 1:3322867/150‑1 GCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATT > 2:8064900/1‑150 ATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCC > 1:6101463/1‑150 ATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCC > 1:2209092/1‑150 ACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCG > 1:3713572/1‑150 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2:2407795/1‑150 TTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTG > 1:8191171/1‑150 TTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGA > 1:5442369/1‑150 GATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGA > 2:4394950/1‑150 GATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGA > 1:586011/1‑150 ATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGAT > 1:939609/1‑150 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acACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTC < 2:7482945/148‑1 AAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTC < 2:6225716/150‑1 AAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTC < 1:6637267/150‑1 AAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCAATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTC < 2:4246071/150‑1 AACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCT < 1:6175303/150‑1 TCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGC > 2:7227472/1‑150 TCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGC > 1:1020219/1‑150 TGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCA < 1:7519549/150‑1 TGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCA < 2:6131848/150‑1 TTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGC > 1:6843518/1‑150 AATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCA < 1:355291/150‑1 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1:7354484/1‑150 TAAACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTAC > 1:3782857/1‑145 AACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACC > 2:1588492/1‑150 ACGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCC > 2:7354629/1‑150 CGATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCC < 1:1668552/150‑1 GATTCCACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCA > 1:2862132/1‑150 CACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCC > 1:8556819/1‑150 ACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTAC < 2:6391994/134‑1 ACTAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTAC > 1:6391994/1‑134 TAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTG > 2:36720/1‑150 TAATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTG > 1:4573105/1‑150 ATTTATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGA < 2:5949406/150‑1 TATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTT < 2:7471440/150‑1 ATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTTT < 2:8331321/150‑1 ATTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTTT < 2:88461/150‑1 TTCCGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTTTC < 1:1975036/150‑1 CGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTTTCGAA > 1:6519054/1‑150 CGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCC > 2:5698486/1‑98 CGTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCC > 2:1320822/1‑98 CGGCCAACGGTTCGACGCATGCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1015989‑1015841‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAGGGATCCATCATCCCCACATTCCAACCGTCCACCTGATTCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCCAGCCCGCCATGATGCGCCCCGACAGCAAAGTCGAAAAAGTCTACCTCTACCCCAAGCCCGTGGACTTTCGAA > NC_002947/4541196‑4541344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |