| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 233,545 | C→T | G548G (GGC→GGT) | PP_0180 → | cytochrome c family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 233,545 | 0 | C | T | 99.8% | 1569.8 / NA | 420 | G548G (GGC→GGT) | PP_0180 | cytochrome c family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (199/220); minor base G (0/1); total (199/221) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 420 total aligned reads displayed.
TCGGTATACCGCGAATTGTTCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGCTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCTTTGAGTTCG > NC_002947/233399‑233690 | tcGGTATACCGCGAATTGTTCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTc > 1:3877215/1‑149 (MQ=255) ccGCGAATTGTTCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGc > 1:5907816/1‑149 (MQ=255) gcgAATTGTTCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTg < 2:4715935/149‑1 (MQ=255) gcgAATTGTTCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTg < 2:3478994/149‑1 (MQ=255) cgAATTGTTCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGc < 2:5984453/149‑1 (MQ=255) cgAATTGTTCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGc > 1:2008807/1‑149 (MQ=255) aTTGTTCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGc < 1:8146170/149‑1 (MQ=255) tGTTCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGcaa > 2:3982045/1‑147 (MQ=255) tGTTCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTa < 2:88723/149‑1 (MQ=255) ttCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATc > 2:5366179/1‑149 (MQ=255) tCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCg > 1:117894/1‑149 (MQ=255) tCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCg > 1:5421944/1‑149 (MQ=255) cGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGc < 1:2374571/149‑1 (MQ=255) 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tCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGttcttc < 1:432713/149‑1 (MQ=255) cTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAg > 1:1416409/1‑149 (MQ=255) cTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAg > 2:4272678/1‑149 (MQ=255) gTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCa < 2:3685395/149‑1 (MQ=255) gTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCa > 2:7529964/1‑149 (MQ=255) ttCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCAt > 2:2843229/1‑149 (MQ=255) ttCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCAt > 2:8219978/1‑149 (MQ=255) aCGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAAc > 2:6150607/1‑149 (MQ=255) cGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAAcg > 2:8151485/1‑149 (MQ=255) gagaCCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAAcgc > 1:8689872/1‑149 (MQ=255) gagaCCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAAcgc > 1:4676726/1‑149 (MQ=255) cTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCgct > 2:6408632/1‑149 (MQ=255) gtgGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCgctgc < 2:3895572/149‑1 (MQ=255) ggggCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCgctgc < 2:5498768/147‑1 (MQ=255) tgGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCgctgct > 1:6385850/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGctgctggg > 2:253381/1‑147 (MQ=255) cTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCtgtg < 2:3294704/149‑1 (MQ=255) gcaggcagGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTgcg < 1:5768557/149‑1 (MQ=255) aggcaggcCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTgcgcg < 1:261715/149‑1 (MQ=255) ggcCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTc < 2:3508385/149‑1 (MQ=255) 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ccgccgGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGgta > 2:2763117/1‑149 (MQ=255) ccgccgGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGgta > 2:7986204/1‑149 (MQ=255) ccgccgGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGgta > 2:2271390/1‑149 (MQ=255) ccgccgGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGgta > 2:141895/1‑149 (MQ=255) aTCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGcc > 2:7196957/1‑149 (MQ=255) aTCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGcc < 2:4842865/149‑1 (MQ=255) aTCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGcc < 1:5078126/149‑1 (MQ=255) aGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCggg < 1:3367661/149‑1 (MQ=255) aGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCggg < 1:7558267/149‑1 (MQ=255) ggCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGc < 2:1187282/149‑1 (MQ=255) cGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCAt < 1:4922689/149‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATgg < 1:4489605/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGc < 2:5164345/149‑1 (MQ=255) gCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCg < 1:3258232/149‑1 (MQ=255) ggCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGa > 1:8349982/1‑149 (MQ=255) ggCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGa < 1:7973337/149‑1 (MQ=255) gCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGaa > 2:5902679/1‑149 (MQ=255) tGGCGCGACGGCTCTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGt < 2:7638820/149‑1 (MQ=255) tGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGt < 2:190166/149‑1 (MQ=255) gcgACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCa < 2:322189/149‑1 (MQ=255) 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ggcctggcctGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCCCAGCacacc < 2:5551674/149‑2 (MQ=255) ggcctggcctGGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCC‑GTGTGCCCAGCacaccg < 1:2973886/149‑3 (MQ=255) gcctggcctgGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACgg < 2:4565363/149‑1 (MQ=255) gcctggcctgGGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACgg < 1:626892/149‑1 (MQ=255) cctggcctggGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCC‑GTGTGCCCAGCacaccggc < 2:2150065/149‑5 (MQ=255) ctggcctggGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGcc > 2:4348551/1‑149 (MQ=255) ggcctggGTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAg < 1:94234/149‑1 (MQ=255) ggTGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGt < 2:1348590/149‑1 (MQ=255) tGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTc > 2:8567879/1‑149 (MQ=255) tGATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGGAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTc > 2:6999845/1‑149 (MQ=255) gATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCt > 1:1048288/1‑149 (MQ=255) gATTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCt > 2:8387545/1‑149 (MQ=255) aTTCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCtt < 2:6738119/149‑1 (MQ=255) tCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCTTTg > 2:861782/1‑149 (MQ=255) tCTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCGTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCTTTg < 2:1518486/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCTTTGa < 1:688206/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCTTTGa < 1:6659330/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCTTTGa < 1:1901375/149‑1 (MQ=255) tGCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCTTTGAg < 1:1239871/149‑1 (MQ=255) gCGGGGTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCTTTGAGt > 2:2906473/1‑149 (MQ=255) gggTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCTTTGAGTTCg > 1:7804462/1‑149 (MQ=255) gggTTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCTTTGAGTTCg < 1:225740/149‑1 (MQ=255) | TCGGTATACCGCGAATTGTTCGAAGTGATCCTGTTCTACGAGACCCTGTGGCTGCAGGCAGGCCCCGCCGGGCATCAGGCGGTGCTGGCGGGTGGCGCGACGGCACTGGTGCTGTTGGTGGGCCTGGCCTGGGTGATTCTGCGGGGCTCGGCCAAGCTGCCGCTATCGCTGTTCTTCAGCATCAACGCCGCGCTGCTGTGCGCGCTGTCGGTAGTATTCGCCGGGCATGGCGTGAAGGCGTTGCAAGAGGCCGGTGTGCTGGGCACACGGCCAGTGGCGTTCTTTGAGTTCG > NC_002947/233399‑233690 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |