| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1015848 = | 0 (0.000) | 30 (1.120) | 25/292 | 0.1 | 67.4% | intergenic (‑75/‑693) | SBRG_Ecoli_galE/prfC | SBRG_Ecoli_galE/peptide chain release factor 3 |
| ? | NC_002947 | 5066251 = | 29 (1.080) | intergenic (‑421/‑70) | PP_4458/PP_4459 | opine ABC transporter substrate‑binding protein/transposase | |||||
ACCCTCTCCGGCCAACGGTTCGACGCATGCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1015997‑1015848‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGTCTGCCACCATTA > NC_002947/5066251‑5066396 ACCCTCTCCGGCCAACGGTTCGACGCATGCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTCATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAAT > 2:86463/1‑150 GCATGCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTC < 1:101230/150‑1 GCATGCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTC > 2:162444/1‑150 CAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTT < 1:293974/150‑1 TCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTG < 2:399648/150‑1 TCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTG < 1:337772/150‑1 TCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTG < 2:399647/150‑1 TTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTC < 1:228819/150‑1 CAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACA < 1:99333/150‑1 CAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACA < 1:405186/150‑1 CAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCACATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACA < 1:197690/150‑1 TTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGAT < 1:79887/150‑1 TCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCAGAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATG < 1:11660/150‑1 ATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAA > 1:18702/1‑150 AAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATT < 2:495337/150‑1 CCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCA > 2:205016/1‑150 CTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAA < 2:225953/150‑1 TCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAG > 2:468815/1‑150 TCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAG < 2:180843/150‑1 ATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAATCATGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCTTG > 2:375606/1‑150 ACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAATTAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGT > 2:281716/1‑150 TTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGA > 1:159116/1‑150 TCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGAT < 1:595425/150‑1 GCGCATAAAAAACGGCTAAATTCGTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGA < 2:136940/150‑1 AAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGACTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGA < 2:276487/150‑1 ACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGC < 1:324644/150‑1 GGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTG > 1:26930/1‑150 TAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAAC > 1:100215/1‑150 TTCCACTAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGTCTGCCA < 1:205016/150‑1 TAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGTCTGCCACCATTA > 2:192271/1‑150 TAATGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGTCTGCCACCATTA > 1:551492/1‑150 ACCCTCTCCGGCCAACGGTTCGACGCATGCAGGCATGAAACCGCGTCTTTTTTCAGATAAAAAGCGCAATCATTCATAAACCCTCTGTTTTATAATCACTTAATCGCGCATAAAAAACGGCTAAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1015997‑1015848‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGTCTGCCACCATTA > NC_002947/5066251‑5066396 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |