Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_002947 | 1,515,811 | (33-bp)2→1 | pseudogene (715‑747/1851 nt) | PP_1325 ← | putative lipoprotein |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_002947 | 1515769 | 1515801 | 33 | 431 [0] | [0] 427 | PP_1325 | putative lipoprotein |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1515802 = | 0 (0.000) | 262 (1.040) | 127/202 | 0.0 | 100% | pseudogene (756/1851 nt) | PP_1325 | putative lipoprotein |
? | NC_002947 | = 1515768 | 0 (0.000) | pseudogene (790/1851 nt) | PP_1325 | putative lipoprotein |
Only 100 of 427 total aligned reads displayed.
ACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGCTTTTCACGGCGAAGGC > NC_002947/1515653‑1515951 | agcgagccgatgcgtgagctgtcgaacacctgtaccgcaggcgctggctggccgctttgctgggcctggaagtgggcggccatgaagccatcgcgcagggcgcgggctacaccggccagcgggccttcctgaggcagcagcagggcgatc > 1:366070‑M1/150‑150 (MQ=255) agcgagccgatgcgtgagctgtcgaacacctgtaccgcaggcgctggctggccgctttgctgggcctggaagtgggcggccatgaagccatcgcgcagggcgcgggctacaccggccagcgggccttcctgaggcagcagcagggcgatc < 2:2522681‑M1/1‑1 (MQ=255) cgagccgatgcgtgagctgtcgaacacctgtaccgcaggcgctggctggccgctttgctgggcctggaagtgggcggccatgaagccatcgcgcagggcgcgggctacaccggccagcgggccttcctgaggcagcagcagggcgatCtt > 1:7604511‑M1/148‑150 (MQ=255) gagccgatgcgtgagctgtcgaacacctgtaccgcaggcgctggctggccgctttgctgggcctggaagtgggcggccatgaagccatcgcgcagggcgcgggctacaccggccagcgggccttcctgaggcagcagcagggcgatCTTg > 1:1199222‑M1/147‑150 (MQ=255) gagccgatgcgtgagctgtcgaacacctgtaccgcaggcgctggctggccgctttgctgggcctggaagtgggcggccatgaagccatcgcgcagggcgcgggctacaccggccagcgggccttcctgaggcagcagcagggcgatCTTg > 2:6117596‑M1/147‑150 (MQ=255) gagccgatgcgtgagctgtcgaacacctgtaccgcaggcgctggctggccgctttgctgggcctggaagtgggcggccatgaagccatcgcgcagggcgcgggctacaccggccagcgggccttcctgaggcagcagcagggcgatCTTg > 1:2488129‑M1/147‑150 (MQ=255) gagccgatgcgtgagctgtcgaacacctgtaccgcaggcgctggctggccgctttgctgggcctggaagtgggcggccatgaagccatcgcccagggcgcgggctacaccggccagcgggccttcctgaggcagcagcagggcgatCTTg > 2:5324866‑M1/147‑150 (MQ=255) gccgatgcgtgagctgtcgaacacctgtaccgcaggcgctggctggccgctttgctgggcctggaagtgggcggccatgaagccatcgcgcagggcgcgggctacaccggccagcgggccttcctgaggcagcagcagggcgatCTTGGt > 2:1872143‑M1/145‑150 (MQ=255) 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tgtcgaacacctgtaccgcaggcgctggctggccgctttgctgggcctggaagtgggcggccatgaagccatcgcgcagggcgcgggctacaccggccagcgggccttcctgaggcagcagcagggcgatCTTGGTCAGCGGctggctgg < 1:4194466‑M1/20‑1 (MQ=255) gtcgaacacctgtaccgcaggcgctggctggccgctttgctgggcctggaagtgggcggccatgaagccatcgcgcagggcgcgggctacaccggccagcgggccttcctgaggcagcagcagggcgatCTTGGTCAGCGGCtggctggc > 2:1640504‑M1/130‑150 (MQ=255) gtcgaacacctgtaccgcaggcgctggctggccgctttgctgggcctggaagtgggcggccatgaagccatcgcgcagggcgcgggctacaccggccagcgggccttcctgaggcagcagcagggcgatCTTGGTCAGCGGCtggctggc < 1:3292798‑M1/21‑1 (MQ=255) gaacacctgtaccgcaggcgctggctggccgctttgctgggcctggaagtgggcggccatgaagccatcgcgcagggcgcgggctacaccggccagcgggccttcctgaggcagcagcagggcgatCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAg < 2:1304762‑M1/24‑1 (MQ=255) acacctgtaccgcaggcgctggctggccgctttgctgggcctggaagtgggcggccatgaagccatcgcgcagggcgcgggctacaccggccagcgggccttcctgaggcagcagcagggcgatCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCt < 2:6796456‑M1/26‑1 (MQ=255) 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2:4616376‑M1/27‑150 (MQ=255) ttcctgaggcagcagcagggcgatCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGt < 1:5581862‑M1/126‑1 (MQ=255) tcctgaggcagcagcagggcgatCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCg > 1:1819572‑M1/24‑123 (MQ=255) tgaggcagcagcagggcgatCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCg < 2:1202248‑M1/130‑1 (MQ=255) tgaggcagcagcagggcgatCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCg > 1:6168613‑M1/21‑150 (MQ=255) gaggcagcagcagggcgatCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCgg > 1:4499416‑M1/20‑150 (MQ=255) 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agcagggcgatCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGCTTTTc > 1:5193993‑M1/12‑150 (MQ=255) cagggcgatCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGCTTTTCAc > 1:5942696‑M1/10‑150 (MQ=255) ggcgatCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGCTTTTCACGGc > 1:3401615‑M1/7‑150 (MQ=255) | ACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCTGCTCCAGGGTGCCGGCGCTTTTCACGGCGAAGGC > NC_002947/1515653‑1515951 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |