| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2842056 = | 285 (0.740) | 113 (0.340) | 63/248 | 6.7 | 38.0% | intergenic (‑16/+167) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/xenobiotic reductase |
| ? | NC_002947 | = 2842143 | 124 (0.380) | intergenic (‑103/+80) | sad‑I/PP_2489 | NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase/xenobiotic reductase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
GTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGAC > NC_002947/2841907‑2842205 | gTAAAGCTGCGTTCTTTCCTGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCg > 1:6238574/1‑150 (MQ=255) tAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgt < 1:408739/150‑1 (MQ=255) tAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgt < 2:6167746/150‑1 (MQ=255) tAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgt > 2:177127/1‑150 (MQ=255) gCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggca > 2:2832500/1‑150 (MQ=255) cTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcat < 2:8484046/150‑1 (MQ=255) cTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcat < 2:3033506/150‑1 (MQ=255) tGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatg > 1:8475181/1‑150 (MQ=255) cGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggt < 1:7367416/150‑1 (MQ=255) cGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGCGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggt < 1:6792332/150‑1 (MQ=255) gTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtg < 2:210137/150‑1 (MQ=255) ttCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtgg > 1:2164567/1‑150 (MQ=255) tCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggc < 1:6005455/150‑1 (MQ=255) tttCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcat > 2:3665380/1‑150 (MQ=255) tttCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcat > 2:6947240/1‑150 (MQ=255) ttCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGCCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatg > 2:7365543/1‑150 (MQ=255) tCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatgg > 2:2907717/1‑150 (MQ=255) cAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtg < 1:8795783/150‑1 (MQ=255) cAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtg > 2:8293681/1‑150 (MQ=255) aGTCGAGGAACGCGCTATGTTCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtgg > 1:3309091/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatgg > 2:5129507/1‑138 (MQ=255) tCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggca > 2:6621602/1‑150 (MQ=255) gAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcgtg > 1:8382284/1‑150 (MQ=255) gAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatg < 2:596243/150‑1 (MQ=255) ggAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggt < 1:8174576/150‑1 (MQ=255) ggAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggt < 1:2653743/150‑1 (MQ=255) ggAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggt < 2:489483/150‑1 (MQ=255) gAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtg < 1:4296041/150‑1 (MQ=255) gAACGCGCTATGTGCGTCGACCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtg > 1:2069698/1‑150 (MQ=255) aaCGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtgg > 2:3510726/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggc < 2:3903071/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggc < 2:8635243/150‑1 (MQ=255) cgcgCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCgtggcatggtggcatggtggcatggtggca > 1:2324134/1‑150 (MQ=255) 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atggtggcttggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatgGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACgtggt < 2:2152283/147‑1 (MQ=255) atggtggcatggtgtcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatgGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACgtggt < 2:5251361/147‑1 (MQ=255) tggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatggtggcatgGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACgtggtg > 1:1036414/3‑150 (MQ=255) | GTAAAGCTGCGTTCTTTCCAGTCGAGGAACGCGCTATGTGCGTCGTCCAGCGCCTGATTGACCTGGTCGTCGGTGGTTTCTGGGAAGGTCTTGAGCAATTCCCCGTTATAGGGGTTGATAGTGGCGTAAGCCATGTGATTCTCCTACTCGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGCATGGTGGAATGGTGGCATGAAAAGCTCCGGTCTTTCCGTACGTGGTGAC > NC_002947/2841907‑2842205 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |