New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 1849128 | 2 (0.010) | 339 (0.910) | 157/280 | 0.3 | 66.1% | coding (657/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS |
? | NC_002947 | 2182694 = | 346 (0.930) | intergenic (+103/‑63) | PP_5485/PP_1931 | GNAT family acetyltransferase/hypothetical protein |
Only 100 of 1148 total aligned reads displayed.
TAAACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGAAAACCCA > NC_002947/2182545‑2182843 | gcatcgactcgcgggaaaccttccagaagaccacgcagttcgtcggcgagttgatgccggaaattgccgaccgcctcaacactacccgggcgagcgcccaatctttgacctgtacggcgtcgaagacgagatccagcgggctctggagcc > 1:2188831‑M2/150‑150 (MQ=255) atcgactcgcgggaaaccttccagaagaccacgcagttcgtcggcgagttgatgccggaaattgccgaccgcctcgaacactacccgggcgagcgcccaatctttgacctgtacggcgtcgaagacgagatccagcgggctctggagcCa < 2:5801884‑M2/2‑1 (MQ=255) ggatttcgatggtttccaggttctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGa < 1:6818711‑M2/4‑1 (MQ=255) tCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACt > 1:2029345/1‑150 (MQ=255) ggTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACtgt < 2:4037855/150‑1 (MQ=255) tgtCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACtgtgt < 1:4051949/150‑1 (MQ=255) gcgggaaaccttccagaagaccacgcagttcgtcggcgagttgatgccggaaattgccgaccgcctcgaacactacccgggcgagcgcccaatctttgacctgtacggcgtcgaagacgagatccagcgggctctggagcCAGACtgtgt < 1:4900806‑M2/10‑1 (MQ=255) gatggtttccaggttctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACtgtgtg > 2:1351125‑M2/140‑150 (MQ=255) ggaaaccttccagaagaccacgcagttcgtcggcgagttgatgccggaaattgccgaccgcctcgaacacgacccgggcgagcgcccaatctgtgaccggtacggcgtcgaagacgagatccagcgggctctggagcCAGACTGTGTGaa > 2:8470125‑M2/138‑150 (MQ=255) accacAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGaaa > 1:5600109/1‑150 (MQ=255) cttccagaagaccacgcagttcgtcggcgagttgatgccggaaattgccgaccgcctcgaacactacccgggcgagcgcccaatctttgacctgtacggcgtcgaagacgagatccagcgggctctggagcCAGACTGTGTGAAAACGcc > 1:1269577‑M2/132‑150 (MQ=255) cttccagaagaccacgcagttcgtcggcgagttgatgccggaaattgccgaccgcctcgaacactacccgggcgagcgcccaatctttgacctgtacggcgtcgaagacgagatccagcgggctctggagcCAGACTGTGTGAAAACGcc > 1:6607273‑M2/132‑150 (MQ=255) ttccagaagaccacgcagttcgtcggcgagttgatgccggaaattgccgaccgcctcgaacactacccgggcgagcgcccaatctttgacctgtacggcgtcgaagacgagatccagcgggctctggagcCAGACTGTGTGAAAACGccc > 2:1239552‑M2/131‑150 (MQ=255) 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tctggagcCAGACCGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATg > 1:2912842‑M2/9‑150 (MQ=255) ggagcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTc > 2:7926237‑M2/6‑140 (MQ=255) gtcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGAAAAc < 2:2653803‑M2/147‑1 (MQ=255) | TAAACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGAAAACCCA > NC_002947/2182545‑2182843 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |