| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,829,283 | C→G | E2301Q (GAA→CAA) | pvdL ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,829,283 | 0 | C | G | 99.7% | 1357.2 / ‑5.0 | 385 | E2301Q (GAA→CAA) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (186/198); total (187/198) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 385 total aligned reads displayed.
GCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGAGCGGTACATAGGCGC > NC_002947/4829136‑4829429 | ccATGGCGAGTTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCa > 2:6870042/2‑150 (MQ=255) cATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAg > 1:5363525/1‑150 (MQ=255) ggCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCt > 2:1850550/1‑150 (MQ=255) gAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCa > 1:7914728/1‑150 (MQ=255) aaCTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAg < 1:5151233/150‑1 (MQ=255) cTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCt > 2:7059291/1‑150 (MQ=255) tCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTg > 2:8015540/1‑150 (MQ=255) tCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTg > 1:8618827/1‑150 (MQ=255) gCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGc < 1:5340260/150‑1 (MQ=255) cATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCa < 2:4007959/150‑1 (MQ=255) aTGGCTGACCACCCCGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGGAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCAc < 2:7741580/150‑1 (MQ=255) tGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCtt > 2:4370242/1‑150 (MQ=255) tGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCtt < 2:4461321/150‑1 (MQ=255) accaccACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCa < 1:8049266/150‑1 (MQ=255) accaccACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCa < 2:6770341/150‑1 (MQ=255) accaccACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCa < 1:5061182/150‑1 (MQ=255) accaccACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCa > 1:872047/1‑150 (MQ=255) accaccACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCa < 1:1004366/150‑1 (MQ=255) caccacGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAgg > 1:7137154/1‑150 (MQ=255) caccacGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAgg > 1:410453/1‑150 (MQ=255) accacGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGc > 2:8370858/1‑150 (MQ=255) cTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGcc < 1:594134/150‑1 (MQ=255) tGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCa < 2:7923430/150‑1 (MQ=255) tGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCa < 2:5263219/150‑1 (MQ=255) tGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCa < 2:6948233/150‑1 (MQ=255) ggTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAgg < 1:4435707/150‑1 (MQ=255) ggTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAgg < 2:4303167/150‑1 (MQ=255) ggTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAgg < 2:4855572/150‑1 (MQ=255) ggTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAgg < 1:852432/150‑1 (MQ=255) tttGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGgt < 1:218418/150‑1 (MQ=255) tttGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCACTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGgt < 2:799807/150‑1 (MQ=255) tGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGgtgt < 1:1234781/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGtgtg > 1:1777232/1‑150 (MQ=255) gTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTgcagc > 2:2183002/1‑150 (MQ=255) aGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAgcg < 1:7370213/150‑1 (MQ=255) gCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAgcgc < 2:1974450/150‑1 (MQ=255) ccTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCa > 2:6634885/1‑150 (MQ=255) ccTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCa < 1:8483684/150‑1 (MQ=255) tGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACg > 2:5444408/1‑150 (MQ=255) aGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGGCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgct < 2:6350507/150‑1 (MQ=255) ggTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgctg > 1:304077/1‑150 (MQ=255) tgtAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGgt < 1:6754943/130‑1 (MQ=255) tgtAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgctggc < 1:3481264/150‑1 (MQ=255) ggtAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgctggc < 2:1261513/149‑1 (MQ=255) gtAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgctggct < 1:1992645/150‑1 (MQ=255) tAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgctggctg > 2:8718867/1‑150 (MQ=255) tCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgctg < 2:5036066/142‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGagca > 1:292787/1‑150 (MQ=255) tCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGCGTGCGCTGCTGCACACcctggg > 1:387148/1‑143 (MQ=255) tCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAACTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGagca > 1:2479961/1‑150 (MQ=255) aGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGagcagc < 1:376449/150‑1 (MQ=255) gTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCaa > 1:7721165/1‑150 (MQ=255) aaGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCAGCCAGCGTGCGCTGCTGCACACCCTGGGCGagctgcctga < 2:1528807/150‑5 (MQ=25) gCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCg > 2:7324340/1‑150 (MQ=255) ccTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGa > 1:3817647/1‑150 (MQ=255) tGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATg < 2:3439938/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGc < 2:5691640/150‑1 (MQ=255) tgctgcGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCgg < 1:1459600/150‑1 (MQ=255) ctgcGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgctggc < 1:4950285/128‑1 (MQ=255) ctgcGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCGGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCt < 1:480442/150‑1 (MQ=255) gcGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGt < 2:2739677/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTc < 1:5816366/150‑1 (MQ=255) aGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCg > 2:4921451/1‑150 (MQ=255) gCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCTCACGATGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGAt < 1:6664270/150‑1 (MQ=255) gCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGCCTTCGAt > 2:7539124/1‑150 (MQ=255) tGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCa > 1:8314930/1‑150 (MQ=255) tGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCa < 2:3805503/150‑1 (MQ=255) tGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCa > 1:6312202/1‑150 (MQ=255) gAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCAt > 2:1464448/1‑150 (MQ=255) aGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATg > 1:6248129/1‑150 (MQ=255) ttGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGAt > 1:6876934/1‑143 (MQ=255) ctacAGCGATGCACCGCTGGAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAgcg > 2:3149212/4‑150 (MQ=255) tCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAgcgc < 2:6712467/150‑1 (MQ=255) aGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgctggc < 2:8593718/106‑1 (MQ=255) aGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAgg > 2:8265538/1‑150 (MQ=255) gCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGc > 1:2617156/1‑150 (MQ=255) tGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTc < 1:6119488/150‑1 (MQ=255) tGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGACTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTc < 1:6223016/150‑1 (MQ=255) taTCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGa < 2:8517320/149‑1 (MQ=255) tCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAgg > 2:2702170/1‑75 (MQ=255) tCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCa < 1:7837491/139‑1 (MQ=255) tCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGc > 1:3372555/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGc > 2:6421778/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCAAGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGc < 2:2821933/150‑1 (MQ=255) gCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCgg < 1:3639191/150‑1 (MQ=255) tAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTAc > 1:1112157/1‑150 (MQ=255) tAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTAc < 1:6510728/150‑1 (MQ=255) cgccAGGCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCggg < 1:928393/150‑1 (MQ=255) ccAGCCTGGCGGCCTCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGagca < 2:3320652/90‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGa < 2:3818600/150‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGa < 2:7835696/150‑1 (MQ=255) ttgcggcATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGAGCg > 1:7586823/3‑150 (MQ=255) tGGCGGCATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGAGCg < 2:1737802/150‑1 (MQ=255) gcggcCTCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGAGCGGt < 2:5613449/150‑1 (MQ=255) gcATCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGCGCGGGTACTCGGGGTCGAGCGGTAcc > 2:3547635/1‑149 (MQ=255) aTCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGAGCGGTACATa < 2:1562682/150‑1 (MQ=255) aTCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGAGCGGTACATa > 1:2702456/1‑150 (MQ=255) tCGTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGAGCGGTACATAg < 1:1540500/150‑1 (MQ=255) gTCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGAGCGGTACATAGgc > 2:2551774/1‑150 (MQ=255) tCTTGCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGAGCGGTACATAGgcg > 1:4543457/1‑150 (MQ=255) | GCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCTGAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCGGTCGAGCGGGTACTCGGGGTCGAGCGGTACATAGGCGC > NC_002947/4829136‑4829429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |