| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,018,201 | 0 | G | A | 99.5% | 1482.2 / ‑4.2 | 420 | intergenic (+144/‑36) | mvaB/PP_mr44 | hydroxymethylglutaryl‑CoA lyase/CrcZ ncRNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base A (223/194); total (224/196) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.62e-01 | |||||||||||
Only 100 of 420 total aligned reads displayed.
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ATAGGTCACACGGGTGTCACATTGGTGTGGGTGAAGTGTTACCTCCCGCACATTTCACAGCAAAAAATCGGGTAACAGGGAAACAAATCGGCAGAATTTCAGGCTGGGTGGTGTCGACCAAAAATCTTAACTCATTAATTTTAAAGGGTTTTCAAAAGTTGGCACGCACCCTGCTATATCTCTGGTACAACAACAAAAAAAACGCGATACCCAATAAAAACAACAGGTAACGGCTCTGACATAACAAGAACAACACGGCAGAGGCGTAGCAAGCAGATTTTTTTGGAGTCGACA > NC_002947/4018054‑4018347 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |