Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,015,820 | A→C | intergenic (‑47/‑721) | SBRG_Ecoli_galE ← / → prfC | SBRG_Ecoli_galE/peptide chain release factor 3 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,015,820 | 0 | A | C | 99.4% | 1266.0 / ‑3.3 | 358 | intergenic (‑47/‑721) | SBRG_Ecoli_galE/prfC | SBRG_Ecoli_galE/peptide chain release factor 3 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base C (164/192); total (165/193) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
Only 100 of 363 total aligned reads displayed.
CAGAGGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCC > NC_002947/1015673‑1015966 | gagGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGAt < 2:2293412/150‑1 (MQ=255) gagGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGAt > 2:1026582/1‑150 (MQ=255) gagGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGAt > 1:2949022/1‑150 (MQ=255) agGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATg > 2:206814/1‑150 (MQ=255) ggTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGc < 2:607048/150‑1 (MQ=255) ttATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGa > 2:2218362/1‑150 (MQ=255) tCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGaaaa > 1:3602751/1‑150 (MQ=255) aaGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGagaa > 1:442383/1‑148 (MQ=255) gAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAgtgt < 1:5141426/150‑1 (MQ=255) gAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAgtgt < 2:4316247/150‑1 (MQ=255) gAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAgtgt > 2:3054165/1‑150 (MQ=255) atgatgACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGa > 1:8038402/1‑150 (MQ=255) gatgaCATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAgtgt > 1:8847698/1‑146 (MQ=255) gatgaCATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAgtgt < 2:8847698/146‑1 (MQ=255) gaCATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATgg < 1:7554336/150‑1 (MQ=255) aCATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGa > 2:1069450/1‑150 (MQ=255) atcatGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAAt > 2:8570673/1‑150 (MQ=255) atcatGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAAt > 2:2812/1‑150 (MQ=255) atcatGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAAt > 2:6506667/1‑150 (MQ=255) tcatGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATa > 1:8430253/1‑150 (MQ=255) tGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAAt < 2:8682242/150‑1 (MQ=255) gACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAAtt > 1:649906/1‑150 (MQ=255) aCCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTa < 1:8570673/150‑1 (MQ=255) ccGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAg < 1:1069450/150‑1 (MQ=255) ccGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAg < 1:4251205/150‑1 (MQ=255) gTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTg < 1:5707693/150‑1 (MQ=255) aGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGt > 1:5975106/1‑150 (MQ=255) aGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGt > 1:5120571/1‑150 (MQ=255) gTAATTGCACACAGGTATGTCTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGtt > 2:782205/1‑150 (MQ=255) gTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGtt < 2:927505/150‑1 (MQ=255) tAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGttt > 2:8122858/1‑150 (MQ=255) tAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGttt < 1:4317153/150‑1 (MQ=255) aaTTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTa < 1:6980989/150‑1 (MQ=255) cacaGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGa > 2:7440968/1‑150 (MQ=255) gTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTa > 1:471139/1‑125 (MQ=255) gTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTa < 2:471139/125‑1 (MQ=255) gTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgt < 2:7004310‑M2/150‑3 (MQ=255) tATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgta > 1:7371589‑M2/1‑147 (MQ=255) aTGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaa > 1:2751884‑M2/1‑146 (MQ=255) aTGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaa < 1:1299831‑M2/150‑5 (MQ=255) gACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagg > 1:6734518‑M2/1‑144 (MQ=255) aCTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAAtt > 2:4425173/1‑143 (MQ=255) aCTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaaggg < 1:3692477‑M2/150‑8 (MQ=255) cTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaaggga > 1:7440968‑M2/1‑142 (MQ=255) ttCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggat < 2:8970366‑M2/150‑10 (MQ=255) tCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACaa < 2:8301320/135‑1 (MQ=255) cAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatcca < 2:7183372‑M2/150‑13 (MQ=255) cAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatcca > 2:6300956‑M2/1‑138 (MQ=255) aaTGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccat < 1:3958949‑M2/150‑14 (MQ=255) aaTGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccat < 2:757180‑M2/150‑14 (MQ=255) aaTGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccat > 2:6802411‑M2/1‑137 (MQ=255) aCCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccc < 2:9364111‑M2/150‑20 (MQ=255) ccGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatcccc > 2:5616613‑M2/1‑130 (MQ=255) ccGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatc < 2:1609144‑M2/144‑15 (MQ=255) ccGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatc > 1:1609144‑M2/1‑130 (MQ=255) cGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatcccca > 2:5195055‑M2/1‑129 (MQ=255) cTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAg < 2:5976762/123‑1 (MQ=255) accaccGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacatt < 2:9459568‑M2/150‑26 (MQ=255) accGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattcca < 2:1153914‑M2/150‑29 (MQ=255) accGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattcca < 2:8814894‑M2/150‑29 (MQ=255) aCCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtcc > 1:9004190‑M2/1‑115 (MQ=255) ccAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtcca < 2:5330258‑M2/150‑37 (MQ=255) cAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccac < 1:8228797‑M2/150‑38 (MQ=255) cAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccac < 1:496464‑M2/150‑38 (MQ=255) cAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAAATctaagggatccataatccccacattccaaccgtccac < 2:4989535‑M2/150‑38 (MQ=255) gAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacct < 1:1009194‑M2/150‑40 (MQ=255) gAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacct > 1:2175508‑M2/1‑111 (MQ=255) ctctCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgat > 1:9613737‑M2/1‑108 (MQ=255) tcATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcc < 1:9290679‑M2/150‑46 (MQ=255) tAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccga > 1:7778956‑M2/1‑102 (MQ=255) tAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccga > 2:5054143‑M2/1‑102 (MQ=255) aaTTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgat < 1:2515817‑M2/150‑50 (MQ=255) aaTTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtc > 2:3958333‑M2/1‑101 (MQ=255) ttCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGc > 2:6707219/1‑51 (MQ=255) ttCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTaca < 1:1497155/91‑1 (MQ=255) ttCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTaca > 2:1497155/1‑91 (MQ=255) tCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgct > 2:2563560‑M2/1‑98 (MQ=255) cTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGt > 2:379566/1‑74 (MQ=255) tCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgc < 2:1801122‑M2/150‑57 (MQ=255) cATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctc < 2:5902451‑M2/150‑59 (MQ=255) ttAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatc > 1:2042770‑M2/1‑90 (MQ=255) ggCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgat > 1:6818181‑M2/1‑87 (MQ=255) ttATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttc < 1:459740‑M2/150‑67 (MQ=255) ttATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttc < 1:3281015‑M2/150‑67 (MQ=255) gTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttct < 1:5887485‑M2/150‑72 (MQ=255) gTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttct > 2:3401690‑M2/1‑79 (MQ=255) tATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctg > 1:5309359‑M2/1‑78 (MQ=255) tATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctg < 1:3029738‑M2/150‑73 (MQ=255) tGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctgga > 1:3133016‑M2/1‑76 (MQ=255) aaaTAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGtt < 1:7089467/62‑1 (MQ=255) aaTAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggctccagcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagcc < 2:8403914‑M2/150‑78 (MQ=255) aaTAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtcc > 1:8924740‑M2/1‑73 (MQ=255) cATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccg < 2:1304585‑M2/150‑84 (MQ=255) aTAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgc > 2:4686059‑M2/1‑66 (MQ=255) aTAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgc > 1:7869998‑M2/1‑66 (MQ=255) aTAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatga > 1:8600520‑M2/1‑61 (MQ=255) aTAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatga > 1:2623072‑M2/1‑61 (MQ=255) tAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgat < 1:765792‑M2/150‑91 (MQ=255) acacAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgc > 2:1241841‑M2/1‑58 (MQ=255) acacAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctg > 1:9495714‑M2/1‑58 (MQ=255) | CAGAGGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCC > NC_002947/1015673‑1015966 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |