| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,165,540 | C→T | L133F (CTC→TTC) | gtsC → | mannose/glucose ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,165,540 | 0 | C | T | 97.6% | 1352.1 / 9.6 | 373 | L133F (CTC→TTC) | gtsC | mannose/glucose ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/4); new base T (185/179); total (190/183) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 373 total aligned reads displayed.
CGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGACGGT > NC_002947/1165394‑1165683 | cgGTGGAGATCAGCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTATTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTc > 2:2330468/1‑149 (MQ=255)cgGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTc < 2:6597561/149‑1 (MQ=255)cgGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTc < 1:1598500/149‑1 (MQ=255)cgGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTc < 1:5727063/149‑1 (MQ=255) gTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCGTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCgg < 1:6734419/149‑1 (MQ=255) gTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCCTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCgg > 2:841807/1‑149 (MQ=255) cTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCaa < 1:4115713/149‑1 (MQ=255) tGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCTGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAg > 1:1221048/1‑149 (MQ=255) gATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGc > 1:9088204/1‑149 (MQ=255) gATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGc < 2:7732590/149‑1 (MQ=255) aTCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCt > 2:1349382/1‑149 (MQ=255) aTCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCt < 1:3308040/149‑1 (MQ=255) tctcCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCtt < 2:7894898/149‑1 (MQ=255) tcCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtgg > 2:1471452/1‑149 (MQ=255) ccACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggc > 1:2088563/1‑149 (MQ=255) aCCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggcct < 1:8081932/149‑1 (MQ=255) ccGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggcctg > 2:8510221/1‑149 (MQ=255) ccGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggcctg > 1:8836842/1‑149 (MQ=255) ccGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggcctg > 2:5100168/1‑149 (MQ=255) gcgATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggcctggc > 2:3604361/1‑149 (MQ=255) gATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCa < 1:4304481/149‑1 (MQ=255) gATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCa > 2:437822/1‑149 (MQ=255) tGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTa > 2:4590079/1‑149 (MQ=255) tGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTa < 1:1714034/149‑1 (MQ=255) aCTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACtg < 2:4535350/149‑1 (MQ=255) gAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACtggtg < 1:5609284/149‑1 (MQ=255) aCGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGc > 1:6427338/1‑149 (MQ=255) ggCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCct < 1:8126255/149‑1 (MQ=255) aTGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggtg > 2:2733606/1‑149 (MQ=255) aTGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggtg < 1:7425553/149‑1 (MQ=255) tgCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggtgctg < 2:5012180/149‑1 (MQ=255) gCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggtgctgg < 2:6935232/149‑1 (MQ=255) cTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggtgctggt > 1:7672927/1‑149 (MQ=255) gTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCtggtgctggtgc > 2:4854549/1‑149 (MQ=255) tCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCa < 2:8694050/149‑1 (MQ=255) cGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCAt > 1:5306422/1‑149 (MQ=255) cGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCAt > 2:7626002/1‑149 (MQ=255) cGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCAt < 1:2513189/149‑1 (MQ=255) cGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCAt > 2:5272598/1‑149 (MQ=255) gATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCAtg < 1:720219/149‑1 (MQ=255) gATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCAtg < 2:810237/149‑1 (MQ=255) aTGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCAtgt > 2:1631194/1‑149 (MQ=255) aTGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCAtgt > 1:403080/1‑149 (MQ=255) aTGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCAtgt < 1:2991574/149‑1 (MQ=255) gtgGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTgg > 1:2117913/1‑149 (MQ=255) cgcTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGTCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTa > 1:1086711/1‑149 (MQ=255) cgcTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTa > 1:4699684/1‑149 (MQ=255) cgcTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTa > 2:4132694/1‑149 (MQ=255) cgcTTCCGAGGGTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTa < 1:5510855/149‑1 (MQ=255) gtCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACgg < 2:8310672/148‑1 (MQ=255) cGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACggcct < 2:5799797/149‑1 (MQ=255) cGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACggcct < 1:5135030/149‑1 (MQ=255) gAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACggcctg > 2:6001892/1‑149 (MQ=255) gAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACggcctg < 1:4481097/149‑1 (MQ=255) 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ccTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATcc < 1:8176562/149‑1 (MQ=255) gCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCg > 2:7006106/1‑149 (MQ=255) gCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCg < 1:7962188/149‑1 (MQ=255) cGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGAc > 1:3614978/1‑149 (MQ=255) ttCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGAcgc > 2:7316070/1‑149 (MQ=255) tCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGAcgcg < 1:6001892/149‑1 (MQ=255) ccAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTAACCACGCTTTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACgcgc < 1:4543925/149‑1 (MQ=255) cAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCTCTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCt < 2:4878320/149‑1 (MQ=255) cAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCt < 1:2913974/149‑1 (MQ=255) aGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTg < 2:5603935/149‑1 (MQ=255) tgctgctgcCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAg < 2:4189056/149‑1 (MQ=255) tgctgctgcCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAg < 1:708874/149‑1 (MQ=255) gctgctgcCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAgg > 1:1045413/1‑149 (MQ=255) gctgctgcCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAgg > 2:4282758/1‑149 (MQ=255) ctgcCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCcgc > 2:1992366/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCcgcgcg > 2:4912135/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCcgcgcg > 2:1782692/1‑149 (MQ=255) cGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCgg > 1:8989214/1‑149 (MQ=255) cGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCgg < 2:3338925/149‑1 (MQ=255) ggCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGt < 1:8510221/149‑1 (MQ=255) cTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTgg < 1:4231888/149‑1 (MQ=255) tCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGa > 2:2123296/1‑149 (MQ=255) cGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGAc > 1:8461150/1‑149 (MQ=255) cGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGAc < 2:403080/149‑1 (MQ=255) cGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGAc > 2:3237980/1‑149 (MQ=255) tCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGACGGt > 2:3081451/1‑149 (MQ=255) | CGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGACGGT > NC_002947/1165394‑1165683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |