New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 699510 | 23 (0.190) | 10 (0.120) +AATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTAT |
9/180 | 4.1 | 25.9% | noncoding (77/77 nt) | PP_t05 | tRNA‑Ile |
? | NC_002947 | = 5312869 | 61 (0.500) | noncoding (1/76 nt) | PP_t51 | tRNA‑Ala | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
AAATCAACATTCGACGCGAATGCTCATTTCTGAGTTTGATCAAGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCCGACCTC > NC_002947/5312740‑5312999 | aaaTCAACATTCGACGCGAATGCTCATTTCTGAGTTTGATCAAGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCatat < 1:542767/136‑1 (MQ=255) aaaTCAACATTCGACGCGAATGCTCATTTCTGAGTTTGATCAAGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCatat < 1:115180/136‑1 (MQ=255) tCAACATTCGACGCGAATGCTCATTTCTGAGTTTGATCAAGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTgg > 1:856959/1‑136 (MQ=255) tCGACGGGAATGCTCTTTTCTTAGTTTGATCAAGTTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACAGCTGACCTCCTGCGTGCAATGCAGGCGCTCTCCCAGCTTAGCTTTGGCCCCGGATTTTGGTAGGTCt < 1:3164154/136‑1 (MQ=18) tCGACGCGAATGCTCATTTCTGAGTTTGATCAAGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCt < 2:2775777/136‑1 (MQ=255) tCGACGCGAATGCTCATTTCTGAGTTTGATCAAGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCt < 2:3056946/136‑1 (MQ=255) aCGCGAATGCTCATTTCTGAGTTTGATCAAGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTggg > 2:570972/1‑136 (MQ=255) gAATGCTCATTTCTGAGTTTGATCAAGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGa > 2:2943206/1‑136 (MQ=255) ttGATCAAGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGc > 1:1661325/1‑136 (MQ=255) aaGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCt < 1:3018576/136‑1 (MQ=255) aGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTc < 1:3191356/136‑1 (MQ=255) aGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTc < 2:2899365/136‑1 (MQ=255) aGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTc < 1:245216/136‑1 (MQ=255) aGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTc < 1:2273722/136‑1 (MQ=255) aaGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTcaccac < 2:733867/136‑1 (MQ=255) aaGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTcaccac > 1:1157096/1‑136 (MQ=255) aGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCttt < 1:2126038/136‑1 (MQ=255) aGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCttt < 2:2636371/136‑1 (MQ=255) tggtggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTAt < 1:1460639/136‑1 (MQ=255) tggtggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTAt < 1:1678716/136‑1 (MQ=255) tgggggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTAt < 1:109757/136‑1 (MQ=255) gtggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGt > 1:666373/1‑118 (MQ=255) gtggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGt < 2:666373/118‑1 (MQ=255) gtggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTc > 2:3045403/1‑122 (MQ=255) gtggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTc < 1:3045403/122‑1 (MQ=255) gtggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATcc > 2:1999069/1‑136 (MQ=255) gtggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATcc > 2:1095061/1‑136 (MQ=255) gtggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATcc > 2:2162715/1‑136 (MQ=255) gtggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATcc > 2:324009/1‑136 (MQ=255) gtggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATcc > 2:664145/1‑136 (MQ=255) tggAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCGTCACCACTCTTTATCCa > 2:2740173/1‑136 (MQ=255) ccAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGc > 2:2224321/1‑136 (MQ=255) aaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCAt < 2:2608358/136‑1 (MQ=255) aTCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCTAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGCCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGc < 1:3038979/136‑1 (MQ=255) cGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTc > 1:2856695/1‑136 (MQ=255) gAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTATATCCAGAGGCATGGGGTGCTCa > 2:1925900/1‑136 (MQ=255) aaCCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCaa > 1:334612/1‑136 (MQ=255) cGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTGTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACAt > 2:2656549/1‑136 (MQ=255) aCCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTccaa > 2:784678/1‑136 (MQ=255) gCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAAt < 1:1095061/136‑1 (MQ=255) gTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTg < 1:1773206/136‑1 (MQ=255) aaGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAg > 2:2384144/1‑136 (MQ=255) aaGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGAGTGCTGAACATTCCAACCAAAATTGGTat > 2:1907473/1‑135 (MQ=255) caggcGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCt < 2:2290495/136‑1 (MQ=255) aggcGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCTg > 1:877587/1‑136 (MQ=255) aggcGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCTg < 1:664145/136‑1 (MQ=255) ggcGCTCTCCCAGCTGAGCTTTGGCCCCGCATATTGGTTGGTCTGGGCAGTTTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCTgg < 1:1907473/136‑1 (MQ=255) cgcTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCACAGGCATGGGGTGCTCAACATTACAACCAAAATTTGTAGGTATGGGc > 1:2411063/1‑136 (MQ=255) gcTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCt > 1:533242/1‑41 (MQ=255) gcTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCt < 2:533242/41‑1 (MQ=255) ctctCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCTGGGCAg > 1:1751545/1‑136 (MQ=255) ctctCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCTGGGCAg > 2:2889469/1‑136 (MQ=255) gCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTGGGTCTGGGCAGATTTGAAc < 1:3206797/136‑1 (MQ=255) gCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAAc < 1:1058558/136‑1 (MQ=255) tGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTg < 1:1881838/136‑1 (MQ=255) gCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCGGGGCAGAATTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCCGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCCg < 1:1677043/136‑1 (MQ=255) aTGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCAGGCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATACCACCCAAAATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCCGccc > 1:3174267/1‑136 (MQ=255) aTGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCCGAcc < 1:2113996/136‑1 (MQ=255) aTGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCCGAcc < 1:1328312/136‑1 (MQ=255) ggCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCCGACCTc < 1:2943206/136‑1 (MQ=255) ggCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGAGTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCCGACCTc < 1:3077540/136‑1 (MQ=255) | AAATCAACATTCGACGCGAATGCTCATTTCTGAGTTTGATCAAGGTAAAGCAAGTGGTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGCATATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCAGAAGAGCCGTCCTCACCACTCTTTATCCAGAGGCATGGGGTGCTCAACATTCCAACCAAAATTGGTAGGTCTGGGCAGATTTGAACTGCCGACCTC > NC_002947/5312740‑5312999 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |