| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,743,202 | C→T | intergenic (+471/+281) | gltA → / ← yeiW | citrate synthase/putative oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,743,202 | 0 | C | T | 94.7% | 246.2 / 2.4 | 76 | intergenic (+471/+281) | gltA/yeiW | citrate synthase/putative oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/1); new base T (35/37); total (38/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCGCCTCCTTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑AACCT‑CCGCCAAC‑T‑GCATTCGTGAACCAAGCAACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCC > NC_002947/4743090‑4743320 | ccGCCTCCTTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGaatcca > 1:2405265/1‑132 (MQ=255) cGCCTCCTTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGaatccag < 2:1521161/136‑6 (MQ=255) gCCTCGTTGAGGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGaatccagg < 1:2142644/136‑7 (MQ=255) tGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGc > 2:2636630/1‑136 (MQ=255) tGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGc > 2:1520709/1‑136 (MQ=255) tGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGc > 2:1642988/1‑136 (MQ=255) cGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGac < 1:162229/136‑1 (MQ=255) cGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGac < 1:3174871/136‑1 (MQ=255) aaTGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACg > 2:663830/1‑136 (MQ=255) aaTGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACg > 2:2636705/1‑136 (MQ=255) agcaCGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTcctcct < 1:2321049/136‑1 (MQ=255) agcaCGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTcctcct < 2:2309959/136‑1 (MQ=255) agcaCGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGCCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTcctcct < 2:188001/136‑1 (MQ=255) gcaCGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTg < 2:2017801/136‑1 (MQ=255) caCGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCTCCTTCGTGCATGAG‑CAGCT‑TCTGCGAC‑TAGCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGc > 1:165036/1‑136 (MQ=255) caCGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGc > 2:2536902/1‑136 (MQ=255) caCGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGc > 2:2502132/1‑136 (MQ=255) caCGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGc > 2:2532357/1‑136 (MQ=255) caCGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGc > 2:2899902/1‑136 (MQ=255) gAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAgcg < 2:1570119/136‑1 (MQ=255) gAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAgcg < 1:2751749/136‑1 (MQ=255) gAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAgcg < 1:1799504/136‑1 (MQ=255) ggcgTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCt > 2:1256145/1‑136 (MQ=255) ggcgTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCt > 2:2258339/1‑136 (MQ=255) ggcgTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGACCTCCTGCAGCGCCTCGACCt > 2:1936089/1‑136 (MQ=255) tCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTcctcct < 2:692348/117‑1 (MQ=255) tCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTcctcct > 1:692348/1‑117 (MQ=255) cACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGcc > 1:1552438/1‑136 (MQ=255) aCCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCa < 1:2258339/136‑1 (MQ=255) ccGGCCATGGCGGATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAg < 2:2339829/136‑1 (MQ=255) ccATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAgcggc < 2:1160003/136‑1 (MQ=255) gCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCtt < 1:1110025/136‑1 (MQ=255) gCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCtt < 1:2899902/136‑1 (MQ=255) cGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTg > 2:2837116/1‑136 (MQ=255) tGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCAc < 1:2291371/136‑1 (MQ=255) gAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACg < 1:1926257/136‑1 (MQ=255) cTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTc < 1:2636705/136‑1 (MQ=255) cTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTc < 1:2536902/136‑1 (MQ=255) cTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTc < 1:2844940/136‑1 (MQ=255) tGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTca < 1:92446/136‑1 (MQ=255) ggTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTcaca > 2:232524/1‑136 (MQ=255) ggTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTcaca > 2:2542789/1‑136 (MQ=255) ataGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACcg > 2:1726775/1‑136 (MQ=255) ataGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACcg > 1:3001871/1‑136 (MQ=255) taGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCGCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACcgc < 1:1325990/136‑1 (MQ=255) taGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACcgc < 1:1474112/136‑1 (MQ=255) taGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACcgc < 1:2112948/136‑1 (MQ=255) taGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACcgc < 1:597932/136‑1 (MQ=255) taGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACcgc < 1:2914977/136‑1 (MQ=255) taGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTGGAG‑CAGCTGCTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCGCGGTCACACcgc < 2:3155098/136‑1 (MQ=255) aGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACcgcg > 1:267622/1‑136 (MQ=255) ggTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGa < 2:1536886/136‑1 (MQ=255) gTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGAt < 1:1330973/136‑1 (MQ=255) tCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATa > 2:1197296/1‑136 (MQ=255) cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAgg < 1:2502132/136‑1 (MQ=255) cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAgg < 1:2532357/136‑1 (MQ=255) ctctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACg < 2:1634587/72‑1 (MQ=255) ctctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACg > 1:1634587/1‑72 (MQ=255) ctctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGCTAGGccg > 1:2254782/1‑135 (MQ=255) ctctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCt > 2:1251288/1‑136 (MQ=255) ctctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCt > 1:785693/1‑136 (MQ=255) ctctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTCGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCt > 2:1961167/1‑136 (MQ=255) ctctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGGCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCt > 2:2891306/1‑136 (MQ=255) tctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGcc > 1:3030119/1‑134 (MQ=255) tctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGcc < 2:3030119/134‑1 (MQ=255) tctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCtt > 2:356474/1‑136 (MQ=255) ctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGa > 1:354394/1‑110 (MQ=255) ctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGa < 2:354394/110‑1 (MQ=255) ctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTg > 2:640099/1‑136 (MQ=255) ctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTg > 1:2970562/1‑136 (MQ=255) aCCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGAt < 1:823833/122‑1 (MQ=255) aCCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGAt > 2:823833/1‑122 (MQ=255) aCCTTCGTGCTTGAGCAGCTT‑CTGCGACT‑T‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTg > 2:53108/1‑136 (MQ=255) cGTGCTTGAG‑CAGCT‑TCTGCGACTT‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGAccc < 1:640099/136‑1 (MQ=255) cGTGCTTGAG‑CAGCT‑TCTGCGACTT‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGAccc > 1:506234/1‑136 (MQ=255) cGTGCTTGAG‑CAGCT‑TCTGCGACTT‑GCATTCGTGAATCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGAccc > 2:1688384/1‑136 (MQ=255) | CCGCCTCCTTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGTCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑AACCT‑CCGCCAAC‑T‑GCATTCGTGAACCAAGCAACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCC > NC_002947/4743090‑4743320 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |