| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_002947 | 3,827,189 | Δ438 bp | coding (385‑822/1020 nt) | ptxS ← | 2‑ketogluconate utilization repressor |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_002947 | 3827189 | 3827626 | 438 | 22 [0] | [0] 23 | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3827188 | 0 (0.000) | 20 (1.290) | 14/266 | 0.2 | 100% | coding (823/1020 nt) | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor |
| ? | NC_002947 | 3827627 = | 0 (0.000) | coding (384/1020 nt) | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor | |||||
GAAGTCGATGCGCCGGGCTGCGCCGCTGTCGCCGCGCAAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/3827033‑3827188‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgatcagcccTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAGG > NC_002947/3827627‑3827771 GAAGTCGATGCGCCGGGCTGCGCCGCTGTCGCCGCGCAAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGAT > 2:98075/1‑150 ATGCGCCGGGCTGCGCCGCTGTCGCCGCGCAAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCT > 2:237699/1‑150 TGCGCCGCTGTCGCCGCGCAAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTA > 2:125082/1‑150 TGCGCCGCTGTCGCCGCGCAAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTA > 2:125069/1‑150 GCGCAAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCAC > 1:211551/1‑150 AAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGG < 2:353488/150‑1 AAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGG < 2:160792/150‑1 CACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTT > 1:122469/1‑150 CACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCATCGCGGTT < 1:285844/150‑1 GGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGT < 1:237699/150‑1 GCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAA < 1:263505/150‑1 GCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAA < 1:57531/150‑1 CGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCT > 2:220774/1‑150 CCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAG > 1:185907/1‑150 CTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGG > 2:134631/1‑150 CTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGG > 2:134624/1‑150 acaaCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGC < 1:79510/110‑1 acaaCGTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGC > 2:79510/5‑114 GTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGA > 2:71207/1‑150 GTCGAGGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGA > 2:71213/1‑150 GGGCGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGG < 1:25484/150‑1 CAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAG < 2:211551/150‑1 AGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAGG < 1:98075/150‑1 GAAGTCGATGCGCCGGGCTGCGCCGCTGTCGCCGCGCAAGCGACCGAGCAGGCTTTCGAAGGCCGCCACGCCGATACGCTCGGTGGGCTGGGCCAGTGCGGTGATGCCTTTGCCGACCAAGGGGTACCAGTCGAGGTCGTCGAGGGCGATCAGCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/3827033‑3827188‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgatcagcccTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAGG > NC_002947/3827627‑3827771 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |