Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NC_002947 1156371 1156390 20 2 [0] [1] 2 PP_1013/yihS sensor histidine kinase/aldose‑ketose isomerase

GGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTT  >  NC_002947/1156311‑1156370
                                                           |
gggTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGttt  >  1:20908/1‑60 (MQ=255)
gggTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGttt  <  2:20908/60‑1 (MQ=255)
                                                           |
GGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTT  >  NC_002947/1156311‑1156370

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: