| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,348,783 | C→T | intergenic (‑243/+511) | galP‑I ← / ← PP_1174 | porin‑like protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,348,783 | 0 | C | T | 97.5% | 702.3 / 2.7 | 203 | intergenic (‑243/+511) | galP‑I/PP_1174 | porin‑like protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/0); new base T (74/123); total (79/124) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.45e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.76e-01 | |||||||||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
GGGGTGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTCGCG > NC_002947/1348637‑1348929 | ggggTGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTa < 1:2064831/150‑1 (MQ=255) tGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAAc < 2:2254549/150‑1 (MQ=255) tGAACGAGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAAc > 2:4594126/1‑150 (MQ=255) aCGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTAt < 2:2490802/150‑1 (MQ=255) cgcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATggg < 2:1610603/150‑1 (MQ=255) cgcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGAGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATggg < 1:3583259/150‑1 (MQ=255) gcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGt < 2:1966205/150‑1 (MQ=255) gcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGt < 1:231938/150‑1 (MQ=255) ggTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGa < 2:1909114/150‑1 (MQ=255) gTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGat > 2:2950527/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGattatt < 2:3301195/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGAttatta > 1:1995571/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGAttatta < 1:2613281/150‑1 (MQ=255) gggCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAg < 2:4505223/150‑1 (MQ=255) gcTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAg > 2:3120085/1‑150 (MQ=255) cTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAgg < 2:2730081/150‑1 (MQ=255) tgcGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGCTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAggg > 1:2926318/3‑150 (MQ=255) aCGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAgggg < 2:380150/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGAt < 1:2421169/150‑1 (MQ=255) tGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATg < 1:1148313/150‑1 (MQ=255) tGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATg < 1:2485984/150‑1 (MQ=255) ggCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATgg < 1:5265862/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATggg > 1:3160333/1‑150 (MQ=255) gCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATggg > 1:1188580/1‑150 (MQ=255) gCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATggg < 1:4129359/150‑1 (MQ=255) aGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCt < 2:3993236/150‑1 (MQ=255) ggCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTg < 1:270311/150‑1 (MQ=255) gCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGACGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGt < 1:2477498/150‑1 (MQ=255) gcgAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATggg < 1:1335296/140‑1 (MQ=255) gcgAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATggg > 2:1335296/1‑140 (MQ=255) gAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCt < 2:4721489/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGa < 2:2530904/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCATCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATa < 1:2035586/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGAAGAGGGGGGGAAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATAAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCt < 2:3508654/150‑1 (MQ=255) gggggAAGTGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGAGTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGa < 2:4034044/150‑1 (MQ=255) gggggAAGCGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGa < 2:1442134/150‑1 (MQ=255) gggggAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGa < 2:4185957/150‑1 (MQ=255) gggggAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGa < 1:4314242/150‑1 (MQ=255) gggggAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGa < 1:3413684/150‑1 (MQ=255) ggggAAGGGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTGGTTGTTATGTGTTGTCGTACAACGCTGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAg > 2:2436473/1‑150 (MQ=255) ggggAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAg < 2:3063046/150‑1 (MQ=255) gAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGtaa > 1:568986/1‑150 (MQ=255) agagGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGtaata > 1:4954613/1‑150 (MQ=255) gggggggCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAg > 1:2728219/1‑150 (MQ=255) ggggggCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTGTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAgg > 2:4355891/1‑150 (MQ=255) ggggCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTc < 1:4072921/150‑1 (MQ=255) gCATCAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTGATGTGTTGTTGTACACCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGTCTGTCAACGGCTGATTGCTGAGTAATTAAGGTCCaa < 2:845577/150‑1 (MQ=255) gCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGAGATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTTTGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGGTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCaa > 2:1176546/1‑150 (MQ=255) gCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACTGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCaa < 2:5127912/150‑1 (MQ=255) gCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCaa < 2:65477/150‑1 (MQ=255) aaCAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAgg > 2:374629/1‑150 (MQ=255) cAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGAc < 1:4416525/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCaa > 1:1636394/1‑150 (MQ=255) ggTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGGAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATc > 1:1066930/1‑150 (MQ=255) gTGCTGCGGGATGGGTGTCGACTTGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCATGGGGAAGTTGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATcc < 1:5112110/150‑1 (MQ=255) gTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATcc < 1:1296178/150‑1 (MQ=255) gTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATcc > 1:170733/1‑150 (MQ=255) gCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCgg < 1:992998/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCgg < 2:2582306/150‑1 (MQ=255) cAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCggg < 2:5298353/150‑1 (MQ=255) gggATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGc < 2:2135221/150‑1 (MQ=255) aTGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGa < 1:5178994/150‑1 (MQ=255) tGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGaa < 1:4654067/150‑1 (MQ=255) gggTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCTAAAATCCGGGCTGCAGAAg < 2:215400/150‑1 (MQ=255) gggTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAg > 1:3985058/1‑150 (MQ=255) gtgtCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGct < 1:3351662/150‑1 (MQ=255) gtgtCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCC‑AAATCCGGGCTGCAGAAGctc > 1:5415333/1‑150 (MQ=255) gACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGcc > 1:4202913/1‑150 (MQ=255) gACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGcc < 1:3648057/150‑1 (MQ=255) agaTGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCg > 2:4864686/3‑150 (MQ=255) aCATGGGTTCGTCCACGGCGTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCg > 1:817537/1‑150 (MQ=255) cATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGt < 2:917523/150‑1 (MQ=255) ctGGGTTCGTCCAAGGCTTTTTGTTTTTTTTATGGTTTTTTTTAAAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTg < 2:3333557/149‑1 (MQ=255) aggggTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTg < 1:4235090/148‑1 (MQ=255) aTGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTg > 1:2810104/1‑150 (MQ=255) tGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTgg < 2:5279295/150‑1 (MQ=255) gggTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGa < 2:3855201/150‑1 (MQ=255) gggTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGa < 2:1155547/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGAct > 2:110354/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGAct > 1:3759768/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGAct > 1:3252725/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCAGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGAct > 1:3373098/1‑150 (MQ=255) tCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACACAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTa > 1:5253588/1‑150 (MQ=255) ccACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTATCAAGGGGAATATGTGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCATAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTAc > 2:676798/1‑150 (MQ=255) ccACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTAc > 1:3425668/1‑150 (MQ=255) cACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCgg > 1:5036232/1‑119 (MQ=255) cACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCgg < 2:5036232/119‑1 (MQ=255) cACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACa < 2:3256982/150‑1 (MQ=255) aCGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAg > 1:123502/1‑150 (MQ=255) cTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAt > 1:5377174/1‑150 (MQ=255) ttgttgTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAta < 2:244819/150‑1 (MQ=255) ttgttgTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAta > 1:2231192/1‑150 (MQ=255) ttttGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGAc > 2:3186418/1‑150 (MQ=255) tttGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACt < 1:417968/150‑1 (MQ=255) gTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTggg < 2:4421131/150‑1 (MQ=255) ttATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTgggg < 1:2950527/150‑1 (MQ=255) ttATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGAT‑GGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGc > 2:4227675/1‑150 (MQ=255) tgttgttgtACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCtctc > 1:2088906/1‑150 (MQ=255) ttgttgTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGGTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCTGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTcgc > 2:1802068/1‑150 (MQ=255) tgttgtACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTcgcg > 2:2510587/1‑150 (MQ=255) | GGGGTGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTCGCG > NC_002947/1348637‑1348929 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |